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新的大量细菌蛋白质数据集

来自瑞士和荷兰的科学家对22种不同生长条件下大肠杆菌表达的蛋白质进行了定量和定性分析。鉴定了超过2,300种蛋白质，一些平均水平为每个细胞一个拷贝。由此产生的数据集描述了细胞中大部分(> 90%)的蛋白质质量，并将成为细胞生物学家的宝库。第一份描述于12月7日在Nature Biotechnology上发表。为了理解细胞中存在的基因组信息与其生理学之间的联系，重要的是评估哪些基因在不同条件下产生蛋白质中具有活性。收集此信息的最直接方法是定量测量细胞中存在的蛋白质。最近技术进步使得绝对
2019-02-13 更新栏目：
蛋白质因子将基因组以弓形为基础进行基因表达

蛋白质因子负责在三维(3D)中组织细胞核内的染色体，形成像礼物弓的形状，当基因组织正确表达时，蛋白质聚集为中心“结”，保持带状DNA环，或存在某些突变时纠结的混乱。这些研究结果发表在Cell上，是由杰克逊实验室教授，Florine Deschenes Roux主席和基因组科学主任Yijun Ruan博士领导的国际合作者团队的研究成果，研究核心中的3D 基因组结构及其关系基因调控和疾病。“这篇论文的意义在于我们先进的三维基因组图谱策略，”阮
2019-02-12 更新栏目：
提出了蛋白质复合物的周期表

今天发表在“ 科学”杂志上的蛋白质复合物周期表提供了一种新的方式来观察蛋白质在自然界中可以构建的各种结构，接下来可能会发现这些结构，并预测如何设计出完全新颖的结构。该表由Wellcome Genome Campus和剑桥大学的研究人员领导的跨学科团队创建，为进化和蛋白质工程研究提供了宝贵的工具。几乎每个生物过程都依赖于蛋白质以特定方式相互作用和组装成复合物，并且许多疾病与复杂组装中的问题相关。支持该组织的原则尚未完全了解，但通过定义蛋白质复合物进化的基本步骤，新
2019-02-12 更新栏目：
新方法可防止某些遗传性疾病中蛋白质合成过早停止

蛋白质形成不当可导致许多严重疾病，从肌营养不良到囊性纤维化。除了确定蛋白质畸形如何导致特定疾病过程的挑战之外，研究中的巨大重要问题是找出预防或减少其引起的病理的方法。今天，冷泉港实验室(CSHL)的一个研究小组在自然生物技术中描述了它们在矛盾地抑制过程细胞方面取得的成功，它已经发展到可以防止不完美的蛋白质被合成。有时，事实证明，让蛋白质合成继续进行是有益的- 但仅限于非常特殊的情况。称为无义介导的衰变或NMD的自然过程使细胞能够检测编码的RNA信息中的错误，称为转录物，当基因被激活时从
2019-02-12 更新栏目：
mRNA组分的倾斜表达与蛋白质产生的微调相关

长期作为DNA和蛋白质之间的简单联系，信使RNA从未提供太多的吸引力。但洛克菲勒大学的新研究表明，该分子可能出乎意料。通过揭示mRNA分子成分表达的广泛差异 - 一些假定不会发生的事情 - 科学家们说他们发现了有趣的表达模式，这些模式表明mRNA分子中某些区域具有意想不到的功能。“我们在mRNA的两个部分的表达中发现的不平衡比率，一个携带蛋白质的代码，一个不携带，但似乎没有随机出现，”资深作者，研究副教授玛丽海因斯说。“我们怀疑这些偏斜比例中的一些可
2019-02-12 更新栏目：
蛋白质结构预测和设计的重大举措

12月16日在自然杂志上探讨了自然界中不存在的全新蛋白质模块化设计的潜力。这些报告是最近一系列定制设计蛋白质的最新进展。天然存在的蛋白质是纳米级机器，几乎可以完成生物中所有必需的功能。虽然已知40多年来蛋白质的氨基酸序列决定了它的形状，但科学家从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构一直是一项挑战。相反，科学家很难设计出折叠成迄今未见过的结构的全新氨基酸序列。蛋白质的结构决定了它可以执行的生物化学和生物学任务的类型。在大自然的论文看一种类型的天然构造的：一个结构组件的重复副本的形成蛋白质。研究
2019-02-12 更新栏目：
科学家们发现了数十亿年前已存在的蛋白质片段

蛋白质和语言有许多相似之处 - 例如，通过适当安排基本构建块来产生它们的意义。德国马克斯普朗克发育生物学研究所所长Andrei Lupas及其团队应用计算方法通过现代蛋白质的比较研究重建原始构建模块。语言学中使用相同的方法通过现代语言的比较来重建古代词汇。在最近的一项研究中，科学家报告了40个祖先的肽片段的鉴定，这些片段可能代表了超过35亿年前第一个蛋白质产生时的可观察残留物。蛋白质是组成积木所有的生命，从细菌到人类。在我们的身体中，它们对于所有化学过程都是必不可少的：它们形成我们的指
2019-02-11 更新栏目：
ORNL无细胞蛋白质合成是潜在的救星

通过能源部橡树岭国家实验室开发的无细胞蛋白质合成系统，可以挽救在偏远地区受伤的士兵和其他人的生命。该设备由该实验室生物科学部门的Andrea Timm和Scott Retterer领导的团队创建，使用微制造生物反应器来促进药物和生物制药的治疗性蛋白质的按需生产。使这些微型工厂无需电池，无需维护生命系统，简化了工艺并降低了成本。“通过这种方法，我们可以更快地生产更多的蛋白质，使我们的技术成为护理点使用的理想选择，”Retterer说。“它无细胞的这
2019-02-11 更新栏目：
实验室团队第一次看到难以捉摸的蛋白质结构

我们的身体由许多不同类型的细胞组成，每个细胞的身份都由不同的基因表达决定。当这种基因表达出错时，会发生癌症和遗传性疾病。微小RNA(miRNA)是基因表达中的重要调节因子，它们在几乎所有生物学背景中起着至关重要的作用，包括发育，分化，炎症，衰老和癌症。在细胞核中，miRNA以一种称为原始microRNA(pri-miRNA)的微小折叠发夹结构开始其过程，并由微处理器复合物识别和处理，微处理器复合物是由一种DROSHA和两种DGCR8蛋白组成的酶排列。微处理器复合物做两件事：它测量pri
2019-02-11 更新栏目：
古老的蛋白质灵活性可以驱动新功能

压力荷尔蒙抑制免疫系统的机制，实际上可能是几亿年前的进化，这种机制在进化中似乎相对较新。一种称为糖皮质激素受体或GR的蛋白质，对应激激素皮质醇有反应，可以采用两种不同的形式结合DNA：一种用于激活基因活性，一种用于抑制它。在12月28日发表在PNAS上的一篇论文中，科学家展示了进化微调如何模糊了GR采用不同形状的能力的起源。埃默里大学医学院生物化学副教授埃里克·奥特伦德博士说：“这突出了最终发展新功能的蛋白质是如何具有这些能力的，因为它们具有灵活性，在其进化史
2019-02-01 更新栏目：
随机突变蛋白质变化与多细胞生命的开始联系在一起

所有这一切都是超过6亿年前的一次突变。通过这种随机行为，一种新的蛋白质功能诞生，帮助我们的单细胞祖先过渡到有组织的多细胞生物体。这是在俄勒冈大学生物化学家Ken Prehoda实验室的基础研究中出现的一些分子时间旅行的情景。eLife是一个开放获取期刊，2012年在霍华德休斯医学研究所，马克斯普朗克学会和威康信托基金会的支持下，详细介绍了蛋白质相互作用带来的突变和变化。该研究有助于解决科学家们关于进化的几个重要问题，Prehoda是化学和生物化学系教授，UO分子生物学研究所所长。它还对
2019-02-01 更新栏目：
研究人员发现了两种对DNA去甲基化很重要的蛋白质

美因茨分子生物学研究所(IMB)的科学家们已经发现，在理解如何从DNA中去除表观遗传标记方面存在缺失的难题。关于DNA去甲基化的研究为在发展和癌症等疾病中发挥重要作用的基本过程提供了新的视角。表观遗传学的定义是基因表达的可遗传变化，这种变化并非源自DNA序列本身的变化。表观遗传过程在广泛的疾病中发挥核心作用，例如心血管疾病，神经退行性疾病和癌症。最显着的表观遗传过程之一是DNA甲基化，其中动物DNA的四个碱基之一用甲基标记。DNA甲基化通常会降低周围基因的活性。关于如何将甲基标记置于
2019-02-01 更新栏目：
细胞质中的蛋白质聚集体干扰重要的运输途径

在患有神经退行性疾病的患者的大脑中，医学研究人员可以观察到蛋白质沉积物，也称为聚集体。多年来，这些聚集体被怀疑会导致神经细胞死亡，以及像阿尔茨海默氏症，帕金森症或亨廷顿氏症这样的疾病。由Mark Hipp和Ulrich Hartl领导的Martinsried Max Planck生物化学研究所的科学家们现已证明，蛋白质聚集体的位置对细胞的存活有很大的影响。虽然细胞核内的聚集体几乎不影响细胞功能，但细胞质内相同蛋白质的沉积会干扰细胞核和细胞质之间的重要运输途径。这导致蛋白质和RNA转
2019-02-01 更新栏目：
生物学家发现了蛋白质生物合成机制的一个新方面

我们在DNA中编码的遗传信息的很大一部分在活细胞中表达为蛋白质。为了合成蛋白质，需要将该信息从核苷酸序列转换为氨基酸的语言。解码的过程称为翻译，它涉及不同的核酸分子，信使RNA(mRNA) - 信息的“临时载体”，它是一个特定基因的拷贝。特殊的分子机器 - 核糖体 - 沿mRNA移动并读取核苷酸三联体。每个三联体编码特定的氨基酸。mRNA核苷酸简单地彼此跟随是具有挑战性的，并且核糖体必须确定开始阅读的地方。如果错误地选择要解码的第一个三联体，则核糖体开始合成错误
2019-02-01 更新栏目：
科学家发现蛋白质在基因组稳定性和可能的癌症预防中起主导作用

如果你对无名英雄情有独钟，那么你会喜欢一种名为XPG的DNA修复蛋白。来自美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)的科学家们发现，XPG起着前所未有的关键作用，有助于维持人体细胞的基因组稳定性。他们的发现也提高了蛋白质有助于预防乳腺癌，卵巢癌和其他与BRCA基因缺陷相关的癌症的可能性。这项研究于2016年1月28日在线发表在“ 分子细胞 ”杂志上，表明XPG对我们的健康至关重要，远远超出了它的重要性。“我们发现了一种”老&ldqu
2019-01-31 更新栏目：
压缩细胞允许递送新的荧光标签以跟踪活细胞中的蛋白质

使用荧光标记(例如绿色荧光蛋白(GFP))标记蛋白质是目前追踪活细胞内特定分子的最佳方式。然而，虽然这种方法已经取得了许多重大发现，但GFP和类似的标签非常大，以至于它们可能会干扰标记蛋白的天然功能。麻省理工学院开发的基于细胞挤压技术的新方法使研究人员能够提供体积小得多的荧光标签，使这种蛋白质成像更容易，更有效。2013年，麻省理工学院的研究小组证明，挤压细胞可以将多种分子(包括蛋白质，DNA，碳纳米管和量子点)输送到细胞中，而不会损坏细胞。德国法兰克福歌德大学的研究人员与麻省理工学
2019-01-31 更新栏目：
直刺依赖于锯齿状蛋白质图案

早期胚胎发育中椎骨的形成需要复杂的遗传舞蹈，需要精确定时和许多不同细胞的相互作用。由分子，细胞和发育生物学系的斯科特·霍利领导的耶鲁大学科学家团队阐明了细胞粘附分子钙粘蛋白在称为体节的节段中发挥的关键作用，这些节段成为椎骨和肌肉组织。在从发育中的斑马鱼中获取的图像中，在脊索的两侧可以看到体节内的钙粘蛋白的锯齿图案，其与体节一起形成脊柱。在鱼类中，体节形成鱼片中的肉片。但是，如果这些结构在鱼类或人类中不能正常形成，则结果可能是椎骨缺陷，例如脊柱侧凸。该研究于2月4日在线发
2019-01-30 更新栏目：
评估蛋白质药物的生物相似性新研究显示方法的精确度

有关四种治疗性蛋白质药物版本的首次实验室间研究 - 均来自活细胞 - 据报道，一种类似于磁共振成像的既定分析工具可靠地评估了生物相似产品的原子结构，产生了相当于指纹的指纹每。今天在“ 自然生物技术”杂志上发表的研究结果表明，在评估这些生物仿制药时，这种方法被称为二维核磁共振光谱或二维核磁共振 - “可以成为公司和监管机构的强大而强大的补充技术”，罗伯特说Brinson，美国国家标准与技术研究院(NIST)的研究化学家。这种类型的评估是确定
2019-01-30 更新栏目：
表达可以召唤怪物基因的Ouija Board蛋白质

类固醇激素是生物活性物质，在个体的发育和性成熟以及维持体内平衡中起重要作用，无论物种如何。类固醇激素通过多步酶促反应从特定内分泌器官中的胆固醇生物合成。因此，重要的是，提供这些生物合成酶的说明的基因组在发生类固醇激素生物合成的器官中以有限的形式表达。虽然在脊椎动物研究方面取得了进展，但控制无脊椎动物类固醇生成器官中有限基因表达的机制在很大程度上是未知的。由筑波大学生命与环境科学学院领导的研究小组副教授Ryusuke Niwa与国家农业生物科学研究所联合研究，研究了果蝇果蝇，发现了一种名
2019-01-30 更新栏目：
无政府主义蛋白质可隐藏秘密以开发具有高抗逆性的作物

有些蛋白质表现得相当无政府主义。解开他们不同寻常的行为可能会保留开发具有更高耐受压力的作物的秘密。哥本哈根大学的一组研究人员将揭开这些无序蛋白质的奥秘，这得益于Villum Foundation Young Investigator Program的700万克朗资助。压力较小的植物通常蛋白质的结构决定了它的功能。然而，由于尚未知的机制，一些蛋白质在没有这种确定性结构的情况下发挥其功能。哥本哈根大学植物与环境科学系DynaMo中心副教授Meike Burow将领导一个雄心勃勃的项目，
2019-01-30 更新栏目：