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新蛋白质测序方法可以改变生物学研究
德克萨斯大学奥斯汀分校的一组研究人员展示了一种新的方法来测序比现有技术灵敏得多的蛋白质,识别单个蛋白质分子,而不是一次需要数百万个分子。这一进展可能对生物医学研究产生重大影响,使得更容易揭示用于诊断癌症和其他疾病的新生物标志物,以及增强我们对健康细胞功能的理解。该团队今天在Nature Biotechnology期刊上发表了他们的概念验证研究结果。“我们基本上已经创造了一种类似DNA测序技术来研究蛋白质,”分子生物科学教授兼新技术共同发明人爱德华马科特说。 该项
2019-03-15 更新 -
细胞垃圾桶揭示了蛋白质在疾病中的作用
如果我们真的想知道我们的身体细胞是如何起作用的,或者在疾病的情况下不起作用,我们可能需要超越它们的基因,甚至超越它们所构成的蛋白质。我们可能需要开始审视细胞“垃圾”。Weizmann科学研究所的Yifat Merbl博士开发了一个系统来做到这一点,发现“细胞垃圾箱潜水”包含有关细胞功能的信息,这是其他情况下看不到的。该小组利用他们的新方法对患有自身免疫性疾病的患者的免疫细胞进行分析,并发现了一种特征性证据,可以提供关于这种疾病根本原因的新
2019-03-15 更新 -
Atg2蛋白在将前自噬体膜束缚到内质网中的作用
博士后哲也小谷,副仁Nakatogawa教授,名誉大隅良典教授和东京工业大学的同事们分析了署理蛋白Atg2,其功能是以前未知的,并已发现Atg2期间系绳自噬体膜前到内质网自噬体形成。自噬是降解细胞成分(如蛋白质,核糖核酸(RNA)和细胞器)的机制,从酵母到人类都是高度保守的。当诸如营养物饥饿等应激诱导自噬时,出现称为隔离膜的扁平膜囊泡并且球状扩张以吞噬待降解的物质,闭合形成称为自噬体的双膜囊泡(图1)。 完成的自噬体然后与溶酶体或液泡融合,自噬体内的物质被溶酶体或液泡内的酶降解。已经鉴
2019-03-15 更新 -
朊蛋白样蛋白质控制雌性小鼠的PTSD症状
哥伦比亚大学Mortimer B. Zuckerman思维脑行为研究所的研究人员报告说,由一种叫做TIA1的基因编码的朊蛋白样蛋白可以帮助大脑控制可怕的记忆。没有这种基因,雌性小鼠表现出创伤后应激障碍或创伤后应激障碍的迹象。这项研究的结果(“TIA1的遗传扰动揭示了恐惧记忆中的生理作用”)发表在Cell Reports上,指出TIA1是抗击创伤后应激障碍的新目标,这在女性中几乎是男性的两倍。 。 “解释生物与环境之间的相互作用,导致所有精神疾病,包括
2019-03-15 更新 -
植物蛋白Feronia如何防止细菌攻击者
爱荷华州立大学的植物科学家对影响植物生长和抗病性的遗传途径有了新的认识,使其成为培育能够在不牺牲性能的情况下对抗病原体的新作物品种的有希望的目标。这项研究于本周发表在同行评审的学术期刊“ 当代生物学”上,详细介绍了Feronia蛋白如何在模式植物拟南芥中发挥作用,促进生长并在细菌病原体存在下赋予抗病能力。 在植物细胞里面的一盘棋 该研究的重点是Feronia,一种在植物细胞中发现的受体激酶蛋白,以前的研究表明它可以参与植物生长和应激反应过程。 当植物受到细菌病原
2019-03-14 更新 -
研究了蛋白质进化的细节
蛋白质控制着细胞的生物学。通过随机突变,我们的蛋白质序列随时间缓慢变化,通常不会影响功能。但有时候会在这个过程中发明新的功能。乌普萨拉大学的科学家们已经在分子学研究中研究过这种情况。结果显示几个因素共同形成塑料蛋白质 - 蛋白质相互作用。在之前的一项研究中,研究小组重建了两种来自灭绝生物的相互作用蛋白。其中一种生物是当今大多数动物的祖先,这些动物大约在6亿年前生活过。另一个是在4.4亿年前呈现的鱼类的祖先。来自这些动物的蛋白质在实验室中复活并使用不同方法分析。现在,研究小组利用核磁共振
2019-03-14 更新 -
研究人员开发了快速测量蛋白质独特振动的方法
在每个生物体的细胞中 - 人类,鸟类,蜜蜂,玫瑰甚至细菌 - 蛋白质以微观运动振动,帮助它们执行从细胞修复到光合作用的重要任务。这些栩栩如生的震颤是3月4日Nature Communications上发表的一项研究的主题。由布法罗大学物理学家Andrea Markelz领导的一个小组报告称,它开发了一种快速测量蛋白质独特振动的方法。 这一进展可以为生物学研究开辟新的可能性,例如更有效地研究蛋白质的微观运动,或利用振动模式作为“指纹”来快速确定实验室样品中是否存在
2019-03-14 更新 -
新的昆虫培养基提供高活细胞密度生长和蛋白质产量
FUJIFILM Irvine Scientific,Inc。是细胞培养基优化和制造的全球领导者,今天宣布推出IS Sf Insect培养基。在Sf9和Sf21细胞中,使用杆状病毒表达系统(BEVS)配制无血清,无动物成分的低水解产物培养基,以实现蛋白质,病毒载体和病毒样颗粒的一致生长和产量的可扩展性。人们越来越关注使用昆虫细胞作为重组蛋白和病毒载体的生产宿主。与BEVS结合使用,昆虫细胞能够在短时间内产生大量具有复杂翻译后修饰的蛋白质。这些昆虫细胞很容易适应高密度培养,这一特征加上其
2019-03-14 更新 -
组织蛋白在细胞核中的血清素修饰
表观遗传学被定义为对遗传性状的研究,其不涉及DNA序列的变化。这种观点已经被大量的生化证据所拓宽,揭示了一系列复杂且通用的分子机制,这些机制在不改变DNA序列的情况下调节基因表达。这些包括DNA和RNA分子的化学修饰,以及组蛋白的翻译后修饰 - DNA周围的蛋白质形成染色质链。组蛋白的翻译后修饰包括在这些蛋白质的特定氨基酸残基处的乙酰化,磷酸化和甲基化(分别添加乙酰基,磷酸基和甲基)1。在自然中写作,Farrelly 等。2 据报道,组蛋白也可以通过添加血清素来修饰,血清素是一种在调节
2019-03-14 更新 -
人LAT1-4F2hc异聚氨基酸转运蛋白复合物的结构
L型氨基酸转运体1(LAT1;也称为SLC7A5)催化的大的中性氨基酸的跨膜通量在一钠和pH无关的方式1,2,3。LAT1,氨基酸-聚胺- organocation超家族的逆向转运,也催化甲状腺激素,药品,和激素前体如渗透升跨膜-3,4-二羟基苯2,3,4,5,6。LAT1过度表达已经在宽范围的肿瘤细胞中观察到,并且因此对于抗癌药物的潜在靶标7,8,9,10,11。LAT1形成与4F2细胞表面抗原的重链异聚氨基酸转运复合物(4F2hc;也称为SLC3A2)-a II型膜糖蛋白,其是用于
2019-03-14 更新 -
组蛋白血清素化是一种允许的修饰 其增强TFIID与H3K4me3的结合
组蛋白的化学修饰可以介导不同的DNA为模板的过程,包括基因转录1,2,3。在这里,我们提供了一类组蛋白翻译后修饰,谷氨酰胺的血清素化的证据,其发生在产生5-羟色胺(也称为5-羟色胺(5-HT))的生物体中组蛋白H3上的5位(Q5ser)。我们证明组织转谷氨酰胺酶2可以使组蛋白H3三甲基化赖氨酸4(H3K4me3)标记的核小体血清素化,导致体内组合H3K4me3Q5ser的存在。H3K4me3Q5ser在哺乳动物中显示出普遍存在的组织表达模式,在脑和肠中观察到富集,两个器官系统负责5-H
2019-03-14 更新 -
机器学习工具箱读取和分析蛋白质序列
法国的研究人员报告称,他们开发了一种机器学习工具箱,可以读取和分析蛋白质序列。他们的研究(“ 从序列数据中学习蛋白质组成基序 ”) 出现在 eLife中。研究表明,当训练读取序列数据时,称为限制玻尔兹曼机器(RBM)的人工神经网络可以提供有关蛋白质结构,功能和进化特征的信息。它被认为是第一种可以仅从序列数据中提取这种细节水平的方法。“进化相关蛋白质序列的统计分析提供了有关其结构,功能和历史的见解。我们展示了Restricted Boltzmann M
2019-03-14 更新 -
流动分级AF4和光散射探测亚微米蛋白质聚集
光散射仪器广泛用于表征溶液中的大颗粒和纳米颗粒。它提供了使用多角度光散射(MALS),差示粘度测量,场流分级(FFF),动态光散射(DLS),电泳迁移率和确定绝对摩尔质量,大小,构象,电荷和相互作用的尖端工具。成分渐变。Wyatt在仪器和软件方面的最新发展使FFF的全部潜力可以为更广泛的用户群所用。在这次采访中,Kim R. Williams和Christoph Johann就新技术及其研究与新闻 - 医学和生命科学进行了交流。 FFF最突出的特点是什么?我们为什么要使用FFF?
2019-03-13 更新 -
UNH研究发现性别偏见的蛋白质如何在自闭症中发挥作用
新罕布什尔大学的研究人员更接近于在确定和表征大脑中某些蛋白质与自闭症谱系障碍(ASD)之间的关系后,帮助回答为什么自闭症在男孩中比女孩多四倍的问题。“我们的研究是第一个研究大脑中蛋白质的性别偏见调节,以及它们如何在影响身体异常变化的过程中发挥作用,导致自闭症,”神秘生物学助理教授宣茂(毛)陈说。 。“我们的研究结果指出了自闭症研究的新方向,并提出了创造新治疗策略的有希望的可能性。”在最近发表在“ 细胞神经科学前沿 &rdquo
2019-03-13 更新 -
三种蛋白质可能在女性生育能力和癌症生物学中起关键作用
根据罗格斯特领导的研究,三种蛋白质在雌性小鼠卵中以惊人的曲折相互调节,这一发现可能在女性生育能力和癌症生物学中发挥重要作用。研究资深作者Karen Schindler是罗格斯大学 - 新不伦瑞克大学遗传学系的不育研究专家,他说,这些蛋白质如何相互调节的意外复杂性并没有出现在任何其他健康细胞类型中。这三种蛋白质是极光激酶A(AURKA),AURKB和AURKC,该研究发表在Current Biology期刊上。 “我们的研究可以提供一种方法来诊断和治疗早期流产导致的某些类型的
2019-03-12 更新 -
蛋白质研究人员破译抗性机制
在世界范围内,抗生素耐药性正在上升。为了理解为什么细菌对先前功能良好的药物免疫,科学家们正在深入研究细胞的分子结构。马丁路德大学Halle-Wittenberg(MLU)的一个研究小组现已成功地从大肠杆菌中分离出一种膜蛋白,并阐明了其分子结构。有了这些信息,他们就能够证明细菌是如何通过强迫药物来摆脱抗生素的。该论文发表在Nature Communications上。细菌的抗生素耐药性是我们这个时代最重要的医学问题之一。如果不加以控制,先前可治疗的细菌性疾病有可能发生严重转变,患者可能会
2019-03-12 更新 -
科学家们发现了控制叶子生长和形状的蛋白质
在秋天,不仅是吸引眼球的颜色,还有不同大小和形状的叶子。但是什么使得不同植物的叶子形状差异如此之大?科隆马克斯普朗克植物育种研究所的科学家们现已发现一种名为LMI1的蛋白质如何控制叶片的生长和形状。来自Max Planck主任Miltos Tsiantis实验室的Francesco Vuolo及其同事正在研究人们在自然界中可以看到的叶子形状的令人眼花缭乱的变化的潜在机制。最近,他们已经开始努力研究很少被人理解的叶子部分,称为托叶。这些生长物在发育期间在叶子的基部形成,并且在不同植物物种
2019-03-12 更新 -
蛋白质相互作用现在可以快速有效地定义
来自Stowers医学研究所的科学家表示,他们已经创造了一种快速有效地定义个体蛋白质结合的新方法。他们在Nature Communications上发表的研究(“ 蛋白质相互作用网络的拓扑学评分”)展示了Stowers研究人员创建的拓扑评分(TopS)算法如何通过组合数据集来识别聚集在一起的蛋白质。科学家解释说,这不仅有助于研究人员识别蛋白质如何发挥生物功能或进行生物过程,该算法还可以应用于先前生成的生物数据以及可能用于收集新信息的其他科学领域。 “
2019-03-12 更新 -
从头开始进化的基因扩大了蛋白质多样性
生物学中最重要的问题之一是新蛋白质在生物体中的进化速度。蛋白质是实现生命基本功能的基石。随着产生它们的基因发生变化,蛋白质也会发生变化,引入新功能或特征,最终可能导致新物种的进化。由芝加哥大学的科学家领导的一项新发表的自然生态学和进化论研究挑战了关于新蛋白质如何进化的经典假设之一。研究表明,DNA的随机非编码区段可以快速进化以产生新的蛋白质。这些从头或“从头开始”的基因提供了一种新的,未开发的方式,蛋白质进化并促进生物多样性。 “使用大的基因组比较,
2019-03-12 更新 -
环形蛋白质复合物与DNA结合
赖斯大学的生物物理学家有一种新的细胞力学理论,这种理论是正确的。JoséOnuchic的Rice实验室确定了缩合蛋白复合物的结构。这项工作解决了这个问题,即复合物是一个单环,它是两条双链DNA还是一个分子“手铐”,由两个连接的环组成,每个环都缠绕着一条双链。由赖斯博士后研究员Dana Krepel领导的团队使用了一套最先进的分析工具来打电话:这是一个单圈。他们的工作是了解蛋白质在整个有丝分裂和细胞生命周期的所有阶段的染色体结构上的活动的第一步。这种
2019-03-11 更新