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关键蛋白可以阻止李斯特菌而不会引发宿主细胞的死亡
新北卡罗来纳州立大学的研究表明,通过诱导细胞死亡来预防病毒感染能力的关键蛋白质也可以阻止某些细菌感染而不会引发宿主细胞的死亡。RIPK3和MLKL蛋白不是杀死胃肠道中受李斯特菌感染的宿主细胞,而是识别细菌的化学成分,MLKL与其结合,防止李斯特菌在保持宿主细胞存活的同时扩散。 “虽然我们已经证明这些蛋白质在肠上皮细胞中具有与在免疫细胞中不同的功能,但我们仍然不确定这种分化是如何或为何发生的,”生物科学和生物科学教授Jun Ninomiya-Tsuji说。描述该研
2019-04-20 更新 -
CRISPR引导的邻近标记解剖基因转录的蛋白质组学编排
比以前的方法更强大,从细胞中标记和收获DNA相关蛋白的新方法可以打开对转录控制的更深入的见解。基因转录需要一个复杂的分子编排技巧,其中许多蛋白质在正确的时间在正确的地方聚集在一起。分离,鉴定和研究这些蛋白质同样复杂,并且现有的这样做的方法虽然强大,但具有限制其效用的限制。例如,广泛使用的染色质免疫沉淀(ChIP)方法依赖于从细胞中捕获蛋白质的抗体。因此,它只能找到一种蛋白质,其中一种蛋白质具有高质量的特异性抗体,并且假定某种蛋白质可能存在于给定基因附近,从而遗漏了人们可能不期望的蛋白质
2019-04-19 更新 -
确定精子尾部组装中的关键蛋白质
发表在“细胞生物学杂志”上的一项研究着重于精子尾部的发育,这种结构使精子细胞能够游泳,因此对于男性的生育能力至关重要。由ICREA研究教授Cayetano Gonzalez在生物医学研究所(IRB Barcelona)领导的小组与意大利锡耶纳大学的Giuliano Callaini团队合作,在“细胞生物学杂志”上发表了一项研究,确定了关键作用由一种名为CENTROBIN的蛋白质在精子尾部发育中起作用。 在苍蝇中,如在人类中,精子细胞(精子
2019-04-19 更新 -
新发现的蛋白质在最早的生物体中运作
地球上的生命依赖于光合作用的二氧化碳(CO2)固定形成有机碳。植物吸收大气中的二氧化碳并将其转化为有机分子,如葡萄糖。这个过程在蓝细菌中进化,后来被传递到真核生物,从而在藻类和植物中产生质体。研究人员现在发现了一种参与这一复杂过程的新蛋白质;它调节进入细胞的二氧化碳摄入量。来自微生物学与感染医学研究所(IMIT)的Khaled Selim和Karl Forchhammer教授以及Max-Planck蛋白质进化研究所和罗斯托克大学的同事描述了他们对保守的环AMP受体蛋白SbtB的发现。最
2019-04-19 更新 -
蛋白质重新充电细胞的运动机械揭示
在赫尔辛基大学进行的研究可能有助于开发能够减缓癌细胞肌动蛋白依赖性运动的特异性抑制剂。线粒体产生的三磷酸腺苷(ATP)是细胞内化学反应的主要能量来源。人通常在一天中产生高达他或她自己的ATP体重。ATP在许多细胞类型中的主要用户是肌动蛋白细胞骨架,其由动态蛋白质细丝组成,其为细胞移动并改变其形状提供力。例如,在神经元和免疫细胞中,估计大约一半的ATP在由肌动蛋白丝的ATP依赖性生长驱动的运动和形态发生过程中消耗。然而,ATP加入肌动蛋白的机制仍然是一个谜。 赫尔辛基大学生物技术研究所的
2019-04-19 更新 -
疾病的蛋白质组学分析
在初诊后5年内,只有四分之一的人被诊断出患有急性髓性白血病(AML)。为了提高存活率,德克萨斯州的研究人员创建了一个在线地图集,用于识别和分类AML诊断中的蛋白质特征。新的蛋白质分类将帮助研究人员和临床医生为患有这种侵袭性癌症的患者推荐更好的治疗和个性化药物。这项突破性研究于本周在Nature Biomedical Engineering上发表。美国德克萨斯大学圣安东尼奥分校的共同资深作者Amina Qutub表示,AML发生在血液和骨髓中,并且“呈现出如此异质的癌症,通常
2019-04-18 更新 -
深度学习模型从氨基酸序列预测蛋白质结构
哈佛医学院的一位科学家利用深度学习来预测任何基于氨基酸序列的蛋白质的三维结构。在今天发表在Cell Systems上的一篇论文中,系统生物学家Mohammed AlQuraishi详细介绍了一种计算确定蛋白质结构的新方法,他说,实现了与当前最先进方法相当的精确度,但速度提高了一百万倍。“蛋白质折叠一直是生物化学家在过去半个世纪中最重要的问题之一,这种方法代表了应对这一挑战的一种全新方式,”AlQuraishi说。“我们现在有一个全新的远景来探索蛋白质
2019-04-18 更新 -
两种蛋白质结合在一起保持心脏健康
根据美国国立卫生研究院的科学家及其合作者的说法,两种与应激激素结合的蛋白质共同作用,维持小鼠的健康心脏。这些蛋白质,称为糖皮质激素受体(GR)和盐皮质激素受体(MR)的应激激素受体协同作用,有助于支持心脏健康。当两种受体之间的信号传递失去平衡时,小鼠患有心脏病。这项工作(“心肌细胞糖皮质激素和盐皮质激素受体直接拮抗调节小鼠心脏疾病”),发表于科学信号,可能会导致,帮助与心脏发作的风险增加人们治疗化合物的开发,根据研究人员。 “压力越来越多地与心脏功能
2019-04-18 更新 -
分子生物学家比较了人类和酵母的FACT
被称为促进染色质转录(FACT)的蛋白质复合物在细胞核内的DNA包装以及肿瘤发生中起作用。密歇根州立大学的一个科学家小组与外国同事合作,报告了这种复合物在人类和酵母中的相似性。这一发现导致了一种新蛋白质在人类中协助FACT复合物的预测。有关该研究的文章发表在Journal of Biological Chemistry上。在真核生物中,遗传信息以DNA编码,大约一米长,但是包裹在细胞核内。DNA分子非常薄,如果它被混乱弄皱,就不可能在没有损坏的情况下解开它。为了阅读遗传密码,必须将其解
2019-04-17 更新 -
直接可视化蛋白质解聚分子机器的动态结构
ClpB是一种以ATP为燃料的蛋白质分子机器,可以解聚并重新激活聚集的蛋白质。通过使用高速原子力显微镜,首次可视化ClpB的构象动力学。ClpB形成开环和闭环,闭环进一步分为三种形式:圆形,螺旋形和扭曲的半螺旋形。这些结构在ATP酶循环期间相互转化以进行蛋白质解聚。该研究将有助于治疗与各种疾病相关并导致工业问题的蛋白质聚集。当蛋白质暴露于热应激之类的应激时,它们会失去其天然结构并形成有毒的不溶性聚集体。细菌分子伴侣ClpB及其酵母同源物Hsp104具有解聚和重新激活聚集蛋白的能力。Cl
2019-04-17 更新 -
工程蛋白质可以改善药物燃料的生物制造生产
普渡大学的研究人员开发了一系列工程蛋白,可以改善生物制药生产过程,生产生物燃料,药品和商品化学品。在生产过程中积聚有毒物质会损害细胞健康,通常会降低产品的总量。很少有工具可以广泛解决这个问题。普渡大学农业与生物工程系助理教授凯文·所罗门及其团队开发了一系列衍生自弹性蛋白样多肽或氨基酸单链的蛋白质。ELP具有响应于特定环境触发因素(例如温度和pH)的聚集的反相变化特性。研究人员将这些ELP融合到转录因子,与DNA结合的蛋白质,控制基因表达和调节有毒物质的积累。 &ldquo
2019-04-17 更新 -
确保抗体蛋白质测序的100%准确性
请概述基于W离子的异亮氨酸亮氨酸测定(WILD™)技术及其如何帮助确保抗体蛋白质测序的100%准确性。抗体蛋白质测序的目的是准确推断出一级序列中存在的每个单个氨基酸。从原始代码中错误测序的表达的抗体蛋白质与原始抗体相比可能引起显着不同的结合行为。甚至一级序列中的单个氨基酸错误也可能对最终抗体结构具有破坏性影响。 在20种氨基酸中,异亮氨酸(Ile)和亮氨酸(Leu)具有相同的分子量,并且使用常规质谱(MS)实验不能彼此区分。因此,通过常规MS方法的蛋白质测序缺乏可靠的准确性
2019-04-17 更新 -
在自组装过程中观察细胞的蛋白质工厂
总部位于柏林的研究人员已经制作了细胞核糖体的快照。他们的研究结果可以让我们走上新一代抗生素的道路。该研究是由Charité - UniversitätsmedizinBerlin和Max Planck分子遗传学研究所的研究人员进行的一项基础科学研究,已在Molecular Cell上发表。核糖体是细胞的“蛋白质工厂”,由两个单元组成:较大的50S亚基和较小的30S亚基。50S亚基又包含33种蛋白质和两种核糖核酸分子。该研究的目的是获得关于
2019-04-16 更新 -
研究人员发现了CRISPR-Cas蛋白的作用和团队合作
佐治亚大学和康涅狄格大学最近发表的研究提供了关于基于RNA的病毒免疫系统的基本生物学机制的新见解,称为CRISPR-Cas。CRISPR-Cas是Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats / CRISPR-associated的缩写,是一种在细菌和古细菌中进化的防御机制,这些单细胞生物用来抵御病毒和其他入侵者的攻击。当细菌受到病毒的攻击时,它会通过将病毒切成碎片并将入侵者DNA的一小部分整合到自己的基因组中来记录
2019-04-16 更新 -
确定了针对'跳跃基因'提供防御的关键蛋白质
尽管它们偶尔在动物发育中起作用,但是转座子(也称为“跳跃遗传元件”)实际上是DNA序列,其有可能移动到基因组内的新位置。它们构成了大多数真核生物中基因组的很大一部分,它们在配子 - 卵子和精子的基因组中的动员 - 对基因组不稳定性构成威胁,从而导致不育。在动物种系细胞中,一种专门的基于小RNA的防御系统,称为Piwi相互作用RNA(piRNA)途径,主要负责抑制转座子,这一过程称为“沉默”。在遗传学领域,果蝇(果蝇)已经成为研究piRNA
2019-04-14 更新 -
抑制AL淀粉样变性的错误蛋白质的分子指向新型疗法
加利福尼亚州洛杉矶 - 斯克里普斯研究中心的科学家已经发现了一组小分子,这些小分子阻止了AL淀粉样变性病的根源蛋白质的结构变化,这是一种进行性的,通常是致命的疾病。小分子与免疫球蛋白结合,后者在人体的免疫系统中发挥重要作用,然后稳定蛋白质的亚基,称为免疫球蛋白轻链。以其天然形状结合和稳定轻链可防止它们错误折叠并形成AL淀粉样变性患者中发现的毒性斑块。通过用荧光团标记轻链并将形状变化与蛋白酶K切割相结合,筛选了近一百万个小分子,以利用荧光偏振防止疾病相关的结构变化。使用该策略作为高通量筛选和各种不
2019-04-12 更新 -
细胞骨架中的支链肌动蛋白对细胞增殖至关重要
所有细胞都具有细胞骨架,允许它们移动并保持其形状。在今天发表在Cell Research上的一篇论文中,科学家们发现这种称为分支肌动蛋白的细胞骨架的一部分对于细胞增殖也是必不可少的。该肌动蛋白将信息传递给细胞周围的空间,环境化学信息,以及它们是否应该增殖。根据CNRS /Écolepolytechnique的研究小组,如果不满足必要条件,这些肌动蛋白纤维不会合成,并且细胞不分裂 - 除了癌细胞,它可以超越这种控制机制并扩散到哪里他们不应该。 该机制可以代表对抗某些类型癌症
2019-04-11 更新 -
将HIV-1包膜糖蛋白结构与smFRET观察到的病毒状态联系起来
的HIV-1包膜糖蛋白(Env的)三聚体介导细胞进入和构象上是动态1,2,3,4,5,6,7,8。通过单分子荧光共振能量转移(smFRET)成像显示,在完整病毒粒子的表面上,成熟的融合前Env从预先触发的构象(状态1)转变为默认的中间构象(状态2)到构象在其被结合到三个CD4受体分子(状态3)8,9,10。目前尚不清楚这些状态如何与已知结构相关。先前已经通过产生可溶的和蛋白水解切割的gp140 Env三聚体来实现HIV-1 Env三聚体的结构表征的突破,所述三聚体通过二硫键稳定,残基5
2019-04-11 更新 -
天然HIV-1包膜蛋白的构象提出了疫苗设计的问题
HIV-1感染宿主细胞的第一步是在病毒表面表达的包膜(Env)糖蛋白与细胞受体的结合。Env是三个异二聚体复合物的亚稳组装体,形成三聚体。写在自然界,鲁等人。1目前发人深省的数据重新启动了对Env三聚体的天然构象状态的搜索。在结合细胞受体之前,Env三聚体处于闭合(也称为天然)构象状态。这种构象掩盖了病毒进入细胞所必需的某些结构域,但是否则将由宿主免疫系统响应HIV-1感染产生的Env特异性中和抗体靶向。与细胞受体的相互作用 - 首先是CD4,然后是共同受体 - 触发构象变化,打开En
2019-04-11 更新 -
蛋白质功能修复精子发生过程中的遗传损伤鉴定
来自巴塞罗那自治大学(IBB-UAB)的细胞生物学,生理学和免疫学系以及生物技术和生物医学研究所的研究人员揭示了在减数分裂重组过程中参与DNA修复的蛋白质ATR的功能。精子细胞发育过程中的位置 - 精子前体细胞 - 以及如何抑制这种蛋白质导致阻止精子发生的异常。这项由Ignasi Roig领导并使用小鼠模型进行的研究最近发表在Nature Communications上。 精子和卵子是通过称为减数分裂的细胞分裂过程形成的。两种类型的细胞都是单倍体配子,即仅含有每个染色体的一个拷贝。在这
2019-04-10 更新