差异甲基化分析eDMR软件分析说明

楼主  收藏   举报   帖子创建时间:  2018-12-22 00:00 回复:3 关注量:171

软件链接地址:https://code.google.com/p/edmr/

该软件是可以基于对methylkit 软件包进行 进一步处理的,在处理和找寻差异甲基化为点和区域,分析的要比 methylkit更加细致。建议使用methylkit主要是对样本间甲基化水平的各种评估,但是寻找差异还是建议使用edmr软件包。

使用的相关脚本如下:

原文来自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102v7js.html

  • ***2amii 2018-09-07 21:52
    #1

    我想问一下您使用edmr是cpg岛的注释文件是如何生成的呢

  • ***1lvl_2001 2017-09-29 20:22
    #2

    为什么只能分析CpG呢?做植物的怎么用软件找DMR啊?DMR一般都是什么标准?我看不同的文献用的标准不一样呢

  • ***1请输入您的QQ号 2018-09-07 21:48
    #3

    cpg岛的bed注释文件使用什么软件生成呢?