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如何批量下载指定的序列？

楼主  收藏   举报   帖子创建时间:  2018-06-06 00:00 回复：1 关注量：105

【絮语】

下载序列简单不过，无非就是联网NCBI主页，选择数据库后输入AC号或GI号后直接下载。但是如何大批量下载，而且下载的序列是指定的AC或GI的呢？实现这一目的通常办法是借助一些生物软件的检索功能，诸如：Bioedit、Geneious、MacVector等。其实，NCBI自带的Batch Entrez 只需简单三步即可轻松完成这一任务。

【准备工作】

创建一个需要下载序列AC号的列表文件，每行一个独立的AC号，保存为文本文件：

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【简要流程】

1. 打开网页，粘贴这个网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez?

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2. 点击“浏览”按钮，选择事先准备带AC号的文本文件后，点击“Retrieve”开始检索，数秒后即可返回检索的序列记录；

3

3. 点击检索到的序列记录“Retrieve records for 48 UID(s)”即可，后面就是“Send to” 保存要下载的序列，后面的操作就不在赘述，详见前面一些相关教程。

4

4. Good luck!

原文转自：http://user.qzone.qq.com/58001704/2

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  • ***1chelsea 2017-03-03 09:40
    #1

    感谢~

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