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最新miRBase物种及其编号

楼主  收藏   举报   帖子创建时间:  2013-01-17 00:00 回复：2 关注量：176

以下是整理的最新miRbase 19版本的物种及其编号。

aae.gff3 Aedes aegypti 埃及伊蚊
aca.gff3 Anolis carolinensis 变色龙
aga.gff3 Anopheles gambiae 冈比亚按蚊
ame.gff3 Apis mellifera 意蜂
api.gff3 Acyrthosiphon pisum 豌豆蚜
ath.gff3 Arabidopsis thaliana 拟南芥
bdi.gff3 Brachypodium distachyon 短柄草
bfl.gff3 Branchiostoma floridae 真红藻
bmo.gff3 Bombyx mori 家蚕
bna.gff3 Brassica napus 油菜
bta.gff3 Bos taurus 牛
cbr.gff3 Caenorhabditis briggsae 新杆状线虫
cel.gff3 Caenorhabditis elegans 秀丽隐杆线虫
cfa.gff3 Canis familiaris 家犬
cin.gff3 Ciona intestinalis 玻璃海鞘
cqu.gff3 Culex quinquefasciatus 致乏库蚊
cre.gff3 Chlamydomonas reinhardtii 莱茵衣藻
crm.gff3 Caenorhabditis remanei 线虫
csa.gff3 Ciona savignyi 海鞘
cte.gff3 Capitella teleta 海蠕虫
dan.gff3 Drosophila ananassae 嗜凤梨果蝇
ddi.gff3 Dictyostelium discoideum 盘基网杆菌
der.gff3 Drosophila erecta 果蝇
dgr.gff3 Drosophila grimshawi 果蝇
dme.gff3 Drosophila melanogaster 黑腹果蝇
dmo.gff3 Drosophila mojavensis 果蝇
dpe.gff3 Drosophila persimilis 果蝇
dps.gff3 Drosophila pseudoobscura 拟暗果蝇
dpu.gff3 Daphnia pulex 蚤状溞
dre.gff3 Danio rerio 斑马鱼
dse.gff3 Drosophila sechellia 果蝇
dsi.gff3 Drosophila simulans 拟果蝇
dvi.gff3 Drosophila virilis 果蝇
dwi.gff3 Drosophila willistoni 果蝇
dya.gff3 Drosophila yakuba 果蝇
ebv.gff3 Epstein Barr virus EB病毒
eca.gff3 Equus caballus 家马
egr.gff3 Echinococcus granulosus 细粒棘球绦虫
emu.gff3 Echinococcus multilocularis 多房棘球绦虫
fru.gff3 Fugu rubripes 红鳍东方鲀
gga.gff3 Gallus gallus 原鸡
ggo.gff3 Gorilla gorilla 大猩猩
gma.gff3 Glycine max 大豆
hcmv.gff3 Human cytomegalovirus 人源巨细胞病毒
hme.gff3 Heliconius melpomene 红带袖蝶
hsa.gff3 Homo sapiens 人
isc.gff3 Ixodes scapularis 肩突硬蜱
kshv.gff3 Kaposi sarcoma-associated herpesvirus Kaposi肉瘤病毒
lgi.gff3 Lottia gigantea 霸王莲花青螺
mdm.gff3 Malus domestica 苹果
mdo.gff3 Monodelphis domestica 短尾负鼠
mdv1.gff3 Mareks disease virus 马立克氏病毒
mghv.gff3 Mouse gammaherpesvirus 68 γ-疱症病毒 68 老鼠
mml.gff3 Macaca mulatta 猕猴
mmu.gff3 Mus musculus 小鼠
mtr.gff3 Medicago truncatula 蒺藜苜蓿
nve.gff3 Nematostella vectensis 海葵
nvi.gff3 Nasonia vitripennis 蝇蛹金小蜂
oan.gff3 Ornithorhynchus anatinus 鸭嘴兽
ola.gff3 Oryzias latipes 青鳉，稻田鱼
osa.gff3 Oryza sativa 水稻
ppc.gff3 Pristionchus pacificus 线虫
ppt.gff3 Physcomitrella patens 小立碗藓
ppy.gff3 Pongo pygmaeus 猩猩
ptc.gff3 Populus trichocarpa 毛果杨
ptr.gff3 Pan troglodytes 黑猩猩
rco.gff3 Ricinus communis 蓖麻
rno.gff3 Rattus norvegicus 大鼠
rrv.gff3 Rhesus monkey rhadinovirus 恒河猴疱疹病毒
sbi.gff3 Sorghum bicolor 高粱
sha.gff3 Sarcophilus harrisii 袋獾
sja.gff3 Schistosoma japonicum 日本血吸虫
sly.gff3 Solanum lycopersicum 番茄
sma.gff3 Schistosoma mansoni 曼氏血吸虫
sme.gff3 Schmidtea mediterranea 真涡虫
spu.gff3 Strongylocentrotus purpuratus 紫色球海胆
ssc.gff3 Sus scrofa 猪
tae.gff3 Triticum aestivum 小麦
tca.gff3 Tribolium castaneum 赤拟谷盗
tgu.gff3 Taeniopygia guttata 斑胸草雀
tni.gff3 Tetraodon nigroviridis 青斑河豚
vvi.gff3 Vitis vinifera 葡萄
xtr.gff3 Xenopus tropicalis 非洲蟾蜍
zma.gff3 Zea mays 玉米
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  • 匿名 2014-07-10 12:09
    #1

    这个得更新了吧~

  • 匿名 2014-12-05 11:18
    #2

    今天也在干这事，结果发现有人先做掉了。非常感激。

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