约翰霍普金斯大学,罗格斯大学,意大利特伦托大学和哈佛医学院的科学家们报告说,他们开发了一种名为LASSO克隆的新分子技术,它可以用来同时分离数千个长DNA序列,比以往任何时候都多可能。他们说,这项新技术加速了蛋白质的产生,这是基因的最终产物,并且可能导致更快速地发现新药和生物标记物,用于治疗数十种疾病。
在6月26日发表于Nature Biomedical Engineering的一份关于该技术发展的报告中,研究人员描述了他们的新分子方法,即在一次反应中同时克隆和表达数千种蛋白质编码DNA序列。从历史上看,通过克隆DNA并表达其蛋白质来确定基因的作用,一次只做一个基因。
“我们的目标是让任何领域的研究人员都能够便宜,轻松地从任何生物体中克隆和表达整套蛋白质,”约翰霍普金斯大学学院病理学助理教授Ben Larman博士说。医学和该研究的共同资深作者。“到目前为止,这种前景对于研究模式生物如果蝇或老鼠的高效研究联盟来说是切合实际的。”
这篇新论文描述了一种新型捕获的DNA链,作者称之为LASSO探针,用于长适配体单链寡核苷酸。这些LASSO探针的集合可用于获取所需的DNA序列 - 就像绳索套索用于捕获牛 - 但在这种情况下,一次只需数千个。
每个靶基因序列长达数千个DNA碱基对,这是基因蛋白编码序列的典型大小。Larman说,这项新技术改进了一种称为分子反转探针(MIPs)的老方法,该方法只能捕获大约200个DNA碱基。
在概念验证研究中,LASSO探针用于同时捕获来自大肠杆菌细菌基因组的3,000多个DNA片段。该团队成功捕获了至少75%的基因目标。研究人员表示,重要的是,这些序列的捕获方式允许科学家分析基因蛋白质的作用,这可以通过赋予抗生素对其他敏感细胞的抗性来证明。
“我们对LASSO克隆的所有潜在应用感到非常兴奋,”Larman说。“我们希望通过大幅扩大可以同时表达和筛选的蛋白质数量,对于许多研究人员而言,有趣的生物学和新的治疗性生物分子的道路将大大缩短。”