DNA修复跳过重提升顺其自然

DNA修复蛋白就像家居维修承包商。两者都需要访问损坏的网站。虽然DNA修复蛋白需要在紧密堆积的染色质中导航，但承包商必须绕过或通过客户的物品，无论客户是囤积者还是风水爱好者。幸运的是，对于DNA修复蛋白质来说，染色质的风水远远超过随意的一瞥。

DNA修复蛋白可以通过新发现的机制检测并结合受损的DNA - 即使它似乎被埋在核小体内。这种机制允许DNA修复蛋白利用核小体DNA的内在动力学，“顺应流动。”不需要额外的分子人员，如核小体移位蛋白。没有重物 - 也就是说，不需要染色质重塑。

Friedrich Miescher生物医学研究所(FMI)的研究人员发现了这种新机制。他们使用低温电子显微镜观察了一种称为紫外线损伤的DNA结合蛋白(UV-DDB)的分子承包商。他们特别感兴趣的是观察当病变附近的DNA卷绕在核小体的组蛋白核心周围时，UV-DDB如何与DNA损伤结合。

UV-DDB在暂时可用时似乎可以捕获紫外线病变。换句话说，无论何时出现小开口，UV-DDB都是机会性的，巧妙地利用大开口或努力为自己制造肘部空间。有关UV-DDB工作习惯的详细信息出现在5月29日的“自然”杂志上，题目为“核小体DNA损伤检测涉及DNA寄存器移位”。

“我们发现，UV-DDB可以将紫外线损伤的核小体与位于面向溶剂的小沟中的病灶结合，而不会影响整个核小体结构，”该文章的作者写道。“在面向组蛋白核心的埋藏病变的情况下，UV-DDB改变了核小体的主要翻译寄存器，并选择性地将病变结合在可接近的暴露位置。”

在确定与核小体周围不同位置的病变结合的各种三维UV-DDB结构后，研究人员得出结论，损伤检测策略取决于DNA病变的位置。在可以直接接触的“可接近的”病变的情况下，UV-DDB紧密地结合病变。识别“闭塞”病变(面向核小体的组蛋白核心)需要额外的步骤：当UV-DDB通过核小体的自然动态暂时暴露时，它们结合UV病变。

“为了想象在分子水平上发生的事情，想象一条缠绕在线轴上的绳子，当它被向前或向后拉一点时就可以进入，”FMI研究员和自然论文的第一作者Syota Matsumoto说。。

研究人员将DNA损伤的机制称为“载玻片辅助位点暴露”。这种新机制独立于染色质重塑器运行，不需要化学能来滑动或去除核小体。

“在过去，核小体被认为是DNA结合蛋白的主要障碍，”该论文的通讯作者和FMI实验室负责人NicolasH.Thomä评论道。“在我们的研究中，我们证明它们不是，并且该系统适合于无论它们在哪里都能结合紫外线病变。

“这项研究真正有力的是，我们发现的机制可以很好地用于许多其他类型的DNA结合蛋白。获取核小体DNA不仅是DNA修复的基础，而且与所有与染色质结合的蛋白质相关。通过我们的研究，我们定义了以前未知的蛋白质获取染色质DNA模板的策略。“