多视角下IBD背后的肠道微生物不稳定性

通过对微生物组进行多学科研究，多机构研究团队获得了炎症性肠病(IBD)期间肠道微生物组功能性失调的综合观点。研究人员，人类微生物组项目第二阶段的参与者报告说，他们已经确定了潜在IBD治疗的有希望的新靶点，包括多不饱和脂肪酸，胆汁酸衍生物和人体免疫应答途径。

这项新研究由哈佛大学公共卫生学院和麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所的研究人员领导，展示了新的数据，工具和方案如何改进IBD和微生物组的研究。首先，这项新研究获得了详细的测量结果，这使得观察和确认先前研究的结果变得容易，例如整体肠道生态多样性的减少以及疾病期间特定“亲”和“抗炎”微生物的获得和丧失。 。

更重要的是，为本研究部署的工具套件允许研究人员确定变化的原因。结果显示，在疾病活动期间，IBD患者的微生物衍生化学物质较少，他们推测可能是由于多种因素共同作用，包括微生物代谢效果较差，营养吸收较差，肠道内水分或血液水平较高，更紧急的排便。这些因素降低了肠道微生物生态系统的整体稳定性，导致IBD患者中不正常的免疫反应和对正常肠道微生物群的过度反应。

详细的研究结果发表在5月29日的自然杂志上，题为“ 炎症性肠病中肠道微生物生态系统的多组学 ”。该文章描述了微生物组测量的集合 - 宏基因组，元变构，代谢组学和其他相应的积极和非活跃的疾病状态。研究结果表明，与溃疡性结肠炎相比，不同形式的IBD-Crohn病对微生物组的活性和组成有不同的影响。

“我们追踪了132名受试者，每人一年，以产生疾病期间宿主和微生物活动的综合纵向分子谱(每次最多24个时间点;总共2,965例粪便，活组织检查和血液标本)，”该文章的作者写道。“我们证明兼性厌氧菌的特征性增加是以专性厌氧菌为代价的，以及微生物转录中的分子破坏(例如，梭菌)，代谢物库(酰基肉碱，胆汁酸和短链脂肪酸)和水平宿主血清中的抗体

疾病活动的时期也以时间变异性的增加为特征，具有特征性的分类学，功能和生化变化。最后，综合分析确定了这种失调的中心微生物，生物化学和宿主因素。“

肠道微生物组是由数万亿微生物组成的群落，包括细菌，病毒和真菌。每个人都有一个独特的微生物组，研究表明，微生物组在包括IBD在内的多种疾病中发挥着重要作用，IBD影响全球超过350万人并且正在普及。IBD是一种慢性疾病，其特征在于缓解期，然后是疾病变得活跃的突然发作。

“鉴于微生物组与我们的健康和福祉有多紧密联系，我们的结果揭示了我们如何避免这种关系出现问题时出现的问题，以及我们如何成为这些终身伴侣的更好管家，”杰森劳埃德 - 普莱斯(Jason Lloyd-Price)曾在哈佛陈学院(Harvard Chan School)和布罗德研究所(Broad Institute)担任研究科学家，并且是该论文的第一作者。

“我们的研究结果为早期发现即将发生的疾病活动突发事件铺平了道路 - 然后可以积极治疗 - 或者可能用于新的生化治疗机会，以鼓励完全缓解IBD，”计算机教授Curtis Huttenhower博士补充道。哈佛陈学院的生物学和生物信息学，以及Broad研究所的准成员和该研究的高级作者。