大规模基因组测序缩小了对Strep A疫苗的研究范围

全球对A群链球菌(Strep A)疫苗的研究已经缩小，此前研究人员通过对跨越10年和20多个国家的项目中的数千个基因组进行测序，确定了几乎所有全球Strep A菌株中的共同基因特征。

Strep A是一种细菌病原体，在世界某些地区是皮肤溃疡和喉咙痛的常见原因。在这些流行地区，大部分人口经常暴露于链球菌A - 未经治疗可导致风湿性心脏病。澳大利亚原住民是世界上风湿性心脏病发病率最高的国家之一。

在全球范围内，由于侵袭性和免疫介导的疾病，Strep A估计每年导致超过50万人死亡。

今天发表于Nature Genetics，由Peter Doherty感染和免疫研究所(Doherty研究所)，英国Wellcome Sanger研究所和昆士兰大学开展的一项研究项目，整理了来自世界各地流行区的Strep A菌株。

墨尔本大学的主要作者，Doherty研究所和Wellcome Sanger研究所的Doherty-Sanger研究员Mark Davies博士表示，Strep A在地方性环境中存在知识差距，大多数关于细菌病原体的信息来自高收入者在澳大利亚，英国和美国设置。

我们对流行地区生活和驱赶疾病的虫子知之甚少。因此，过去10年来，我们一直在整理来自世界各地的分离物 - 非洲，太平洋，新西兰和澳大利亚原住民社区 - 以确定病原体的具体情况，它如何引起疾病以及为什么它在流行地区有所不同到高收入地区。“

使用大规模基因组测序，我们发现存在超过290种遗传上不同的临床重要链球菌A谱系，突出了设计有效的全球疫苗所面临的挑战。“

墨尔本大学Mark Davies博士，第一作者

该项目发现目前领先的Strep A候选疫苗在链球菌流行环境中最需要疫苗的地区覆盖范围有限。

来自Wellcome Sanger研究所和剑桥大学的作者Gordon Dougan教授表示，世界各地数百万人受到Strep A的影响。“然而，使用我们收集的所有数据，我们缩小了全球几乎所有Strep A株系中常见的基因特征，这是确定可能作为全球候选疫苗的重要一步，”戴维斯博士说。

“这可能会导致一系列疾病，从英国的喉咙痛和猩红热的爆发，到导致澳大利亚土着居民等人群中的风湿性心脏病的感染，”杜根教授说。

“除了帮助研究疫苗外，我们研究的基因组数据还将帮助研究人员了解Strep A如何导致疾病，以及为什么高收入地区与流行地区不同。”

今年2月，澳大利亚医学研究未来基金宣布注入3500万美元用于推动Strep A疫苗的开发。

澳大利亚传染病研究中心主任，昆士兰大学的Mark Walker教授说，这项研究有可能快速追踪Strep A疫苗。

沃克教授说：“疫苗开发人员和更广泛的科学界现在可以使用我们创建的数据库来确定最常见的基因，以帮助开发可能有效的A群链球菌疫苗。”

“我相信全球疫苗是可能的 - 通过我们和其他研究结果重新获得动力，除了增加资金承诺，将增强全球疫苗的推动力。”