线索可可发酵病原体的先天耐药性

乍一看，酵母Candida krusei看起来像微生物一样无害：它用于发酵可可豆，给巧克力带来令人愉悦的香气。但它越来越多地被发现作为免疫功能低下患者的病原体 - 而克鲁氏菌感染并不总是容易治愈。这种酵母天然对氟康唑具有抗性，氟康唑是一种抗真菌药物，不仅对治疗许多真菌感染至关重要，而且对易感人群也有预防作用。在G3的9月号中，Cuomo等人。揭示了C. krusei临床样本的第一个全基因组序列，提供了对该物种的氟康唑抗性可能很重要的基因的引导。

C. krusei基因组的一些组装草稿是在这些研究人员的工作之前产生的，但是它们是碎片化的，这是由大量杂合性引起的问题。他们成功的关键是产生长的测序读数，产生一个比C没有更多支架的组装.krusei有染色体。

随着他们的新选秀，Brand等人。在C. kruseigenome中搜索了与更熟悉的白色念珠菌发病相关的基因 - 鹅口疮，阴道酵母菌感染的原因，以及有时可能致命的全身性感染。他们发现，C.krusei几乎没有与白色念珠菌发病相关的基因家族拷贝，包括寡肽转运蛋白，天冬氨酰蛋白酶和磷脂酶B基因。常常引起疾病的念珠菌物种通常在这些基因家族中具有扩增，因此鉴于C. krusei很少致病，这一发现是有意义的。

当他们关注与抗药性相关的基因时，该研究小组发现C. krusei与白色念珠菌不同;许多在抗性白色念珠菌中的唑类药物靶标中经常突变的位点在克鲁氏菌中没有突变。这意味着可可发酵酵母对氟康唑的天然抗性来自与通常允许白色念珠菌抵抗唑类药物的机制不同的机制。

研究人员还没有找到基因MDR1，它编码一种药物转运蛋白，通常负责对多种药物的耐药性。他们没有，不过，发现编码相关联的其它运输相关的CDR1，CDR2，和其他几个基因的拷贝药物耐药，虽然他们在克柔念珠菌的运作方式是未知的。这些基因可能是发现克柔念珠菌抗真菌耐药机制的起点，可能为高度脆弱的人群提供更好的治疗和预防措施。