科学家已经解开了驯鹿的基因组

随着万圣节的结束，今天传统上是圣诞节装饰品出现的那一天，因此与节日相关的标志性动物通过加入物种清单以对其进行基因组测序来获得节日精神的跳跃是恰当的。今天在开放获取期刊GigaScience上发表，是一篇描述驯鹿基因组测序和分析的文章。这项工作尽管不太可能揭示圣诞老人的驯鹿可以飞行的原因，但它为进一步了解进化，驯化，畜牧业和适应极端环境的过程提供了巨大的资源。

驯鹿(Rangifer tarandus)是鹿或Cervid家族中唯一完全驯化的物种。它也是世界上唯一分布的鹿：跨越北亚，北美和欧洲的北方，苔原，亚北极，北极和山区。与所有其他的鹿不同，它不仅是生长和脱落鹿角的雄鹿，也是雌性。来自畜牧业从观点来看，驯鹿牛奶的蛋白质含量更高，乳糖含量低于牛奶。鉴于世界上乳糖不耐受人群的百分比很高，后一方面使得这种牛奶的可用性成为可能。凭借这些独特的功能，驯鹿基因组序列的可用性可以提供完整的雪橇充满新信息，并且是驯化物种的精英俱乐部的受欢迎的新成员，其具有参考基因组，包括牛，绵羊和山羊。

这项工作由长春中国农业科学院和西安西北工业大学的中国研究人员组成。研究人员从中国大兴安岭的游牧鄂温克族猎人牧民饲养的两头雌性驯鹿中采集了一份血样。他们对基因组进行了测序，组装和注释，并证明它具有高质量。驯鹿基因组与相关物种和人类基因组的比较显示，驯鹿基因组大小(2.6 GB或26亿碱基对)略小于人类，牛和山羊，大小与绵羊大小相同。

该论文的第一作者，中国农业科学院特种动植物科学研究所副教授李哲平指出，该分析还确定了“335驯鹿特异性基因可能有助于了解特殊的生物学特性在驯鹿和其他反刍动物之间的未来比较基因组学研究中，这些对于了解驯鹿以及整个Cervid家族的进化也非常有用。“

考虑到这一目标，研究人员还利用新的基因组和牛家族成员已有的基因组构建了一个进化树。他们发现大约2960万年前驯鹿，牛和山羊与共同祖先分开。这是在渐新世时期，其中一个主要变化是草原的全球扩张。

本文是首届GigaScience竞赛和奖项赛道的获奖者之一，该赛道用于推广新的，前沿的研究。作者在BGI第12届年度基因组学国际会议的特别会议上介绍了他们的工作10月27日星期五在深圳。作为一项开放科学竞赛，本次和其他获奖者的文章以完全开放的方式进行了审查，公众可以在Biorxiv预打印服务器上公开提供该条草案的整个出版过程，完成同行评审过程在学术卡玛覆盖审查系统的出版决定之前提供评论，然后是编辑决定，稿件修订和文章发布，所有编辑，作者和评论者的信件都与已发表的文章一起提供。