新的计算机程序可以帮助破解精准医学

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-05-18 浏览次数:94

澳大利亚国立大学的研究人员帮助开发了一个新的计算机程序,以找出一个人的基因构成,使我们更接近精准医学的时代。

这个名为Flye的程序为计算机组装基因组提供了一个循序渐进的过程 - 一个人的完整基因集 - 并使该过程比现有的最佳实践方法更快,更准确。

澳大利亚国立大学研究员余林博士表示,这一突破将有助于更好地预防,预测和诊断疾病,以及改善治疗,疾病管理和治疗。

“我们希望我们的创新将帮助人们更长寿,更好地生活 - 特别是患有目前无法治疗的疾病的人们,”计算机科学研究院的林博士说。“精准医疗是通过个人基因组学推进的,其重点在于个体的独特基因特征。”

林博士说,通过使用长DNA序列,新的计算机程序将提高基因组组装的可靠性,并导致一系列生物医学应用。

“使用长DNA序列而不是从基因组中随机取出的短序列 - 这是目前使用的流行方法 - 为各种医疗用途和其他应用的准确性,速度和实用性的巨大进步打开了大门,”他说。

“这将开辟一系列生物医学应用,例如增强遗传疾病筛查和针对当今无法治愈的疾病的个性化治疗。”长序列的范围在5,000到20,000个DNA字母之间,而短序列通常是200个字母。人类基因组中基因的长度从数百到数十万个字母不等。

林博士表示,由于基因组测序的价格持续下降,计算成本可能会开始主导许多测序项目。“我们需要更高效的模型和算法,比如我们创建的模型和算法,以尽可能降低计算成本,”他说。

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