CRISPR可以发现癌症的重大变化

在第一次大规模分析癌症基因融合，这是由两个先前分离的基因合并而来的，Wellcome Sanger研究所的研究人员，EMBL-EBI，Open Targets，GSK及其合作者使用CRISPR来揭示哪些基因融合是对癌细胞的生长至关重要。该团队还发现了一种新的基因融合体，它可以为多种癌症提供新的药物靶点，包括脑癌和卵巢癌。

今天(5月16日)在Nature Communications上发表的研究结果为使用特定基因融合物诊断和指导患者治疗提供了更多的确定性。研究人员表示，基于肿瘤中发现的基因融合，现有药物可以用于治疗一些患有胰腺癌，乳腺癌和肺癌的人。

由两种不同基因的异常连接引起的基因融合在癌症的发展中起重要作用。它们目前被用作诊断工具*，以预测特定癌症患者对药物的反应以及预后，以估计给予最佳护理的患者的结果。它们也是一些针对癌症的最新靶向治疗的目标。

到目前为止，研究人员已经确定了大约20,000个**基因融合体，但是它们在发展癌症方面的确切功能和作用仍然知之甚少。辨别在癌症存活中发挥作用的融合与不具有重要临床意义的融合之间存在差异。

在第一项基因融合功能的大规模研究中，Wellcome Sanger研究所，EMBL-EBI，Open Targets，GSK及其合作者的研究人员分析了来自43种不同癌症类型的1,000多种人类癌细胞系中的8000多种基因融合，包括临床需求未得到满足的儿科癌症和癌症。

该团队针对超过350种抗癌药物测试了这些细胞系，以了解哪些现有药物可以重新用于治疗具有基因融合的癌症患者，并使用CRISPR作为工具来发现哪些关键基因融合对癌细胞存活至关重要。

研究小组发现，90%的基因融合在癌症中不起重要作用。当从患者肿瘤的基因组序列推断癌症的原因时，应该考虑这些结果。

来自Wellcome Sanger研究所的共同第一作者Gabriele Picco博士说：“大多数基因融合对于癌细胞的存活并不是必不可少的。随着基因组测序患者的肿瘤变得更加普遍，那些解释数据的人必须要小心。考虑特定的基因融合是否会导致癌症。“

研究人员还发现了一种新的融合体YAP1-MAML2，它对多种癌症类型(如脑癌和卵巢癌)的进展至关重要。

来自Wellcome Sanger研究所和开放目标的主要作者Mathew Garnett博士说：“我们发现了一些基因融合，这些都是癌症存活的关键。这些基因改变可能为现有药物治疗患者提供机会，或者可能成为药物未来的目标。我们发现了一种新的基因融合体YAP1-MAML2，它为包括卵巢癌在内的多种癌症提供了新的药物靶点。“

结果还表明，涉及RAF1，ROS1和BRD4的基因融合可以被现有药物靶向，这意味着可以为患有罕见亚型胰腺癌，乳腺癌和肺癌的患者提供新的治疗选择。

现任EMBL-EBI和Open Targets的Julio Saez-Rodriguez博士现在在海德堡大学工作，他说：“人们之间的癌症存在差异，对这些差异的基因组观点正在增加我们对癌症的理解并为患者开放治疗方案这项研究提供了进一步利用基因融合作为治疗生物标志物的机会，并将患者分层进入临床试验，可能提供更有针对性和有效的临床研究。“