Ontogeny描述了来自单个全能细胞的复杂多细胞生物的出现。由于自我更新和分化之间的不确定关系，祖先田间大小的变化以及这些动物的内部妊娠，该领域在哺乳动物中特别具有挑战性。
在这里，我们提出了一个灵活的，高信息，多通道的分子记录仪，具有单细胞读数，并将其作为一个不断发展的谱系示踪剂，用于组装从受精到原肠胚的小鼠细胞命运图。
通过将谱系信息与单细胞RNA测序谱相结合，我们概括了不同组织类型之间的典型发育关系，并揭示了胚胎外胚胎和胚胎起源的内胚层细胞几乎完全的转录收敛。
最后，我们应用我们的细胞命运图来估计胚胎祖细胞的数量及其在规范期间的不对称分配程度。我们的方法能够在哺乳动物系统中大规模并行，高分辨率地记录谱系和其他信息，这将有助于构建用于理解发育过程的定量框架。
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