高中学生与RIT科学家一起发表论文分析稀有细菌

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-04-26 浏览次数:27

第一次在科学实验室工作的三名高中生在罗切斯特理工学院教授的带领下取得了令人惊讶的发现。现在,这些年轻女性是科学论文的共同作者,宣布了一种杀死大肠杆菌的罕见细菌。

Atlantis Aziz-Dickerson,Joyceline Dweh和D'Asia Buchanan - Uncommon Schools罗切斯特高中的前辈 - 在RIT基因组学实验室中与教师导师AndréHudson分离,鉴定和遗传测序了Yimella细菌的基因组。 RIT的Thomas H. Gosnell生命科学学院。Yimella的种类产生抗生素化合物,其抑制至少两种细菌,埃希氏菌属和芽孢杆菌属,两者都含有对人类致病的物种。

他们的研究结果将发表在4月25日出版的美国微生物学会微生物学资源公告中。该文章“分离,全基因组测序和注释Yimella sp.RIT 621,一种产生针对大肠杆菌ATCC 25922和枯草芽孢杆菌BGSC 168的抗生素化合物的菌株”,列出了高中学生和主要作者Anutthaman Parthasarathy,RIT博士后研究员;Narayan Wong,基因组学实验室技术员;和Nicholas Burns,四年级生物技术和分子生物科学专业,以及RIT教员Michael Savka和Hudson。

在秋季学期的RIT基因组学实验室工作,学生们使用先进的测序平台Illumina MiSeq新一代测序仪分离,提取和测序细菌的全基因组--320万个碱基对。该团队对基因组信息进行了注释,并分析了细菌的基因组,以揭示该生物体的独特性质。

“我们一起努力,”布坎南说。“知道我是这个发现的一部分对我来说真的很令人兴奋,因为不是每个人都有相同的机会,因为我们来自一个我们没有很多机会被发表并且处于这种情况的地方,这是非常有益的。“

Aziz-Dickerson从门把手中分离出细菌,通往RIT科学学院大楼或Gosnell Hall的演讲厅。高中毕业生计划在大学学习生物医学科学和生物学。

“抗生素耐药性是我们这个世界的一个增长因素,”阿齐兹 - 迪克森说。“我们擦了一个门把手,其中一个浴室干手器和一部手机,我们分离出三种不同的细菌。我们不知道我们分离的细菌的属或种。我们发现它抑制了两种不同的生长细菌种类。“

哈德森将这个顶点项目转向生物勘探 - 寻找具有可利用特性的独特细菌。他惊讶地发现这个物种。

“这个是独一无二的,”哈德森说。“我们的论文是为数不多的研究之一,细菌产生化合物来杀死其他细菌。我认为科学是一种服务,我们正在为科学界提供这种菌株。我们需要做后续实验,但这种Yimella菌株可能是分离化合物以制造新抗生素的候选药物。“

抗生素和抗真菌药物的耐药性在世界范围内越来越受到关注,制药公司正在努力弥补开发新药治疗感染的时间。哈德森说,过度使用和缺乏对抗生素的管理以及药物批准程序的障碍是罪魁祸首。

“我们市场上的药物在一段时间内运作良好但由于自然演化现象而停止工作,”哈德森说。“如果你继续用同一种药物对同一种生物体或生物体进行长期攻击,那么它们就能找到一种方法来规避它。我们并没有同时发现或开发药物以适应进化的速度。我们最终知道这将会到来,这只是一个时间问题。“

来自Rochester Prep的近20名学生在秋冬期间访问了RIT,与教授合作开展了各种科学,生物医学,可持续发展,游戏设计,新闻摄影和社会学项目。许多罗切斯特大学预科学生将成为他们家中第一个上大学的学生。像顶点项目这样的体验式学习机会让他们一睹大学的文化和步伐。

“我以前从未去过实验室,”Dweh说。“我已经知道在我上大学时会发生什么,因为我有这样的经历。做这个顶点项目让我离开了我的舒适区,我认为这对我将来有所帮助。”

当哈德森了解到这个机会时,他毫不犹豫地自愿成为一名顶尖导师。

“我为这个节目感到鼓舞,”哈德森说。“我今天是一名科学家,因为有人花时间做我希望我为这些学生做的事情。”

顶点计划源于特许高中和大学之间的独特关系。Rochester Prep High School是屡获殊荣的包机管理组织Uncommon Schools的成员,于2014年开业,通过RIT受托人Ron Zarella的捐赠与RIT建立了牢固的合作伙伴关系。

“Zarella礼物支持RIT将相关资源用于所有Rochester Prep学生100%大学毕业的目标,”RIT战略规划和特别计划副总裁Kit Mayberry说。“RIT参与高中并不是一种招聘工具;就像Uncommon Schools一样,它帮助毕业的老年人找到最适合他们才能和兴趣的大学。”

指导合作伙伴关系RIT方面的梅伯里认为,这种独特的联盟可以成为其他城市学校的典范。

“理所当然,高等教育应该成为学生为成功的大学生涯做好准备的主要因素,”梅伯里说。“尽管不是所有罗切斯特大学预科学校的学生都将成为科研论文的共同作者,但这种合作关系为他们所有人提供了大学成功的巨大优势。”

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