ScarTrace有助于了解多细胞生物如何从胚胎祖细胞中发育

发布日期：2019-04-24 浏览次数：79

研究人员开发了一种使用单细胞测序进行全生物克隆追踪的新方法。在他们发表在Nature杂志上的论文中，该小组描述了他们如何使用他们的新方法对条形码斑马鱼细胞进行研究。

正如研究人员指出的那样，胚胎发育是人类等高度复杂生物的重要阶段 - 只有非常有限数量的胚胎祖先能够以某种方式产生所有在成体体内结束的细胞。为了理解这个过程是如何工作的，研究人员进一步指出，需要一些方法来测量发生的克隆历史，同时以单细胞分辨率进行细胞识别。在这项新的努力中，研究人员开发了一种名为ScarTrace的技术。该名称来自该技术的一部分，该技术涉及添加荧光蛋白转基因的串联拷贝，这使得可以鉴定由CRISPR-Cas9基因编辑引起的转录中留下的“瘢痕”。

利用该技术，研究人员能够追踪编码斑马鱼细胞的克隆根和细胞结果。更具体地说，他们能够追踪成人细胞从几个部位，如肾脏，眼睛和鳍到特定的祖细胞。他们注意到该技术足够灵敏，可以研究祖先承诺产生左眼或右眼时发生的过程。他们还发现，细胞在皮肤和尾鳍来自同一祖先出现。他们报告了鱼鳍中免疫细胞的鉴定，其中克隆来源于其他种类的血细胞。

研究人员提出像他们这样的方法将有助于追踪从单个细胞到完全发育的身体的所有事件的最终目标。支持这一说法的是来自中国，英国和美国的另一个团队的工作 - 他们在同一个自然问题上发表了一篇论文，用他们开发的称为MAP-seq的单细胞测序方法详细描述了他们自己的工作。