根据2018年4月25日发表在MartinSøe的开放获取期刊PLOS ONE上的一项研究,从古代厕所中回收的寄生虫卵中的DNA为过去种群食用的食物以及动物驯化和狩猎实践提供了新的线索。丹麦哥本哈根大学及其同事。
感染人体肠道的寄生虫产生的卵子随后会排泄在粪便中。这些寄生虫可能从人类传播到人类,或者它们可能通过肉类消费或受污染的土壤从中间动物宿主(例如猪或鱼)传播。
以前的研究通过使用显微镜来鉴定过去的饮食来识别古代废物中的寄生虫卵,但DNA测序技术的进步为这一领域开辟了新的机会。在这项新研究中,Søe及其同事使用一种新方法检测来自巴林,约旦,丹麦,荷兰和立陶宛古代厕所的寄生虫卵中的DNA。
与先前的研究不同,研究人员首先将寄生虫卵过滤并浓缩在其样本中,这些样本跨越公元前500年(巴林)至公元1700年(荷兰)。这个初始步骤确保它们具有足够量的DNA用于称为鸟枪测序的技术。得到的DNA序列反映了哪些寄生虫物种由卵代表。
大多数卵子DNA来自已知从人类传播到人类的寄生虫,但很多来自通过未加工或未煮熟的鱼和猪肉传播的寄生虫。卵DNA还揭示了哪些动物驯化或未驯化的动物可能生活在人类中,如绵羊,马,狗,猪和老鼠。
为了补充鸡蛋分析,研究人员还检查了样本中的动物和植物DNA。动物DNA反映了驯化以及狩猎和捕鱼的做法;一些丹麦样本(公元1018年至1400年)含有长须鲸,狍和野兔的DNA。植物DNA反映了不同地区的饮食,包括北欧的大量卷心菜和荞麦。
The shotgun sequencing results also enabled the research team to fully reconstruct several ancient parasites' mitochondrial genomes—DNA in energy-producing structures known as mitochondria, which are found in many organisms' cells. Mitochondrial DNA can reveal evolutionary relationships, and the researchers anticipate that, in future studies, this novel strategy could yield further insights into ancient parasites and their spread among hosts.
“来自厕所的古老DNA用于识别各种人类和动物寄生虫以及动植物的遗骸,”MartinSøe说。“这使得对过去人口的寄生,饮食和生存模式有了新的独特见解。”