为了描绘哺乳动物内胚层的个体发育，我们产生了112,217个单细胞转录组，代表了小鼠胚胎中的所有内胚层群体，直到midgestation。
通过使用基于图的方法，我们模拟了分化细胞的发育轨迹的时空表征，并定义了伴随着第一个(原始或胚胎外)内胚层群体及其姐妹多能(胚胎)外胚层谱系出现的转录结构。
我们揭示了这两个谱系的后代之间的关系，其中外胚层细胞在原肠胚形成之前和期间的两个不同时间点分化成内胚层。内胚层细胞的轨迹被绘制成它们获得胚胎与胚胎外的命运，当它们在新生的肠道内胚层中空间会聚时;揭示它们在全球范围内相似但保留了其血统历史的各个方面。
我们观察了沿着急诊肠管前后轴的细胞区域化特征，反映了它们的胚胎或胚胎外胚层，以及它们与器官特异性区域的坐标模式。
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