新工具有助于基于RNA的细胞通讯研究

科学家已经提高了他们对基于细胞外RNA(exRNA)的新型细胞 - 细胞通讯的理解。为了更好地理解这个系统，科学家创建了exRNA Atlas资源 - 人体exRNA在体液中的第一个详细目录。他们还开发了网络可访问的计算工具，其他研究人员可以使用它们从他们自己的数据中分析exRNA。这项研究发表于今天的Cell，它提供了第一个“地形图”，使科学家们能够研究exRNA在健康和疾病中的潜在作用。

“大约10年前，科学家们开始发现由exRNA介导的细胞之间的新通信系统，”贝勒医学院的相应作者Aleksandar Milosavljevic说。“该系统似乎在正常生理条件下以及癌症等疾病中起作用。”

研究人员很快意识到exRNA通信系统比最初假设的要复杂得多。现有的实验室方法未能可重复地分离exRNA及其载体。为了帮助创建这个复杂的通信系统的第一张地图，Milosavljevic和他的同事使用计算工具将复杂信息分离成更容易理解的组件。

研究人员发现，由于生物系统的自然复杂变化，计算方法有助于揭示以前在个别研究中无法检测到的生物信号。例如，在运动挑战研究中，他们的计算方法揭示了运动前后HDL颗粒和人血浆中囊泡中exRNA货物比例的差异。“使用计算解卷积，我们发现六种主要类型的exRNA货物及其载体可在体液中检测到，包括血清，血浆，脑脊髓液，唾液和尿液，”共同第一作者Oscar D. Murillo说。“载体就像分子血管一样，将RNA载体运送到全身。它们包括脂蛋白 - 主要载体之一是高密度脂蛋白(HDL或“好胆固醇”) - 各种含有小蛋白质的颗粒和小囊泡，所有这些都可被细胞吸收。“

“运动增加了参与调节代谢和肌肉功能的RNA分子的比例，表明机体对运动挑战的适应性反应，”Milosavljevic说。“这一发现开启了这样一种可能性：在健康或疾病的其他条件下，计算方法可能会识别出可能具有生理和临床相关性的信号。”

为了帮助世界各地的研究人员进行分析，Murillo，Milosavljevic及其同事在https://exrna-atlas.org上提供了一个在线计算工具。