犹他大学的一组研究人员发现核小体可以抑制CRISPR / Cas9的切割效率。在他们发表在“美国国家科学院院刊”上的论文中,该小组描述了对酵母样本的基因编辑技术及其发现的测试。
基因编辑技术CRISPR-Cas 9使用指导RNA来寻找和剪切DNA片段 - 但当目标片段是核小体的一部分时会发生什么?先前的研究表明,在这种情况下,切割效率可能会受到影响。在这项新的研究中,研究人员对此类实例进行了体内试验,发现先前的研究结果是正确的 - 在核小体上使用CRISPR-Cas 9可能效果不佳。
DNA链很小,但如果伸展的话,真的很长 - 大约6英尺长。因此,细胞具有将DNA包装到细胞核中的机制。该机制涉及将链转变成围绕给定蛋白质的束。这种卷起的束称为核小体。逻辑表明,由于可访问性问题,编辑DNA链的技术可能会遇到困难。其他研究人员已经考虑过这种问题的可能性,但他们已经在试管中对它们进行了研究,或者对已知不属于核小体的链进行了研究。在这项新的研究中,研究人员试图一劳永逸地找出CRISPR-Cas9的编辑链是否与生物组织核小体的一部分一样好,就像它在非生物组织中一样。
该工作涉及使用活酵母中的不同指导RNA编辑CRISPR-Cas9基因,其允许编辑不同的靶标。一些靶标在核小体中,而另一些则不在。
研究人员报告说,核小体的切割效率远低于非核小体区域的切割效率。但他们也找到了别的东西 - 当用同样的方法测试称为锌指的基因编辑技术时,他们发现没有这样的差异。该小组建议,在未来,基因编辑工作应从核小体位置图开始,以提高效率。