肠道微生物在哺乳动物进化中的作用开始变得更加清晰

由俄勒冈州立大学的科学家领导的国际合作在理解哪些数万亿的肠道微生物可能在人类和其他哺乳动物如何进化中发挥重要作用方面取得了重大进展。

研究人员提出了一种对微生物进行分类的新方法 - 一种根据其祖先和哺乳动物的共同分布对它们进行分类的分类法。调查结果于本周在mBio上发布。

相应的作者，俄勒冈州立大学科学学院的微生物学和统计研究员托马斯·夏普顿说，新的算法和相应的软件被称为ClaaTU-分支分类单位的简称 - 锐化和微调了澄清潜在生态或进化机制所需的重点。

分支是一群被认为是共同祖先的生物。

“肠道微生物组对人类和老鼠等哺乳动物的健康至关重要，因此它也可能影响哺乳动物在自然界中生存和繁殖的能力，”主要作者，科学学院的博士后学者Christopher Gaulke说。“如果是这样，那么肠道微生物组可能会影响动物的进化，使携带适当肠道微生物的个体更容易茁壮成长。”

Gaulke和Sharpton与俄勒冈州立大学微生物学和兽医学院以及伊利诺伊大学和蒙特利尔魁北克大学的合作者共同开发了ClaaTU。

ClaaTU识别出多个哺乳动物群落中出现的微生物分支，其频率高于预期。那些在哺乳动物微生物组中“保守”的人可能会扮演并继续扮演其宿主的重要角色。

“识别与哺乳动物进化相关的肠道微生物是评估肠道微生物影响进化的这一大胆想法的第一步，”Sharpton说。“通过使用我们的新方法比较哺乳动物物种的微生物组，我们能够发现一系列这类微生物。”

另一个发现：与非西方人类和非人类灵长类动物相比，人类生活在“西方生活方式 - 即食用高脂肪和低纤维饮食 - 强烈地远离肠道微生物群进化枝。这表明生活方式，环境和生活方式的改变。 /或与西方化相关的遗传学与肠道细菌进化枝的保护有关。

“这是一个观察，提升了人们对工业化可能影响我们人类祖先进化到的肠道微生物群的担忧，”Sharpton说。“但是，未来的工作将需要确定本研究中发现的肠道微生物是否真正影响哺乳动物的生理学，这种方式对它们的进化很重要。”