关于逆转录病毒宿主共同进化的新知识

逆转录病毒通过将其基因插入宿主基因组中而使脊椎动物宿主定居数百万年，使其能够通过世代继承作为内源性逆转录病毒(ERV)。乌普萨拉大学的研究人员现在通过研究野生和家兔群体中的ERV变异和分离，提供关于逆转录病毒及其寄主的长期关联的新知识。该研究结果发表在美国国家科学院院刊(PNAS)上。

逆转录病毒，例如人类的HIV，必须成为宿主细胞核DNA的一部分，以产生新的病毒。数百万年的时间尺度，生殖细胞的逆转录病毒浸润已被宿主的后代遗传为ERV，其构成了今天脊椎动物基因组的大部分。

研究人员利用最近的技术进展对来自野生和家养宿主的全基因组进行了基于人群的分析，这为ERV-宿主基因组变异提供了新的见解。作为一个模型，研究人员研究了欧洲兔子，它们在大约一百万年前分化为伊比利亚半岛的两个亚种，大约1000年前在法国南部被驯化。

“通过研究来自相关宿主群体的全基因组序列与单个个体的基因组相比，我们可以识别新的ERV以更好地了解逆转录病毒 - 宿主的共同进化，”该研究的第一作者Daniel Rivas说。

利用来自许多兔群的数百人的数据，研究人员能够识别以前未知的逆转录病毒插入，并确定参考基因组中存在的那些的扩散。ERV多样性主要遵循兔差异，结果表明不同兔群体中ERV插入的显着差异。这一新知识揭示了ERV如何在宿主种群中传播，以及这种传播如何与宿主物种的进化相关联。

“我们从宿主群体中发现的丰富和分离变异表明基因组ERV记录是逆转录病毒 - 宿主关联的进化观点的显着来源，”该研究负责人Patric Jern说。