科学家破解了超级食物海藻的基因组

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-03-15 浏览次数:42

沿着日本冲绳岛的热带海岸线,农民每年种植一系列美味的海藻,收获数千吨的作物。

不幸的是,科学家们预测,污染和海洋温度上升会削弱这种令人印象深刻的产量,迫使农民采用新的栽培技术。最近,冲绳科学技术研究生院(OIST)的科学家解码了流行的褐色海藻ito-mozuku(Nemacystus decipiens)的基因组,提供的数据有朝一日可能对当地农民至关重要。

该研究于2019年3月14日发表在“科学报告”上,展示了世界上第一个ito-mozuku的基因组草图。就在三年前,该部门发布了另一种当地可食用海藻物种Cladosiphon okamuranus的第一个基因组草图,称为Okinawa mozuku。两种海藻都含有极高浓度的岩藻依聚糖,这种粘性物质被认为可以阻止血凝块和癌症肿瘤的形成,以及其他健康益处。研究人员已经发现了哪些基因推高了这种褐藻糖胶浓度,这一发现可能会在保健食品行业中得到应用。

除了揭示使mozuku具有健康益处的基因外,该研究还可用于农业。

“我未来的计划是建立培育这一物种的新方法,”该研究的第一作者Koki Nishitsuji博士说道,他是OIST海洋基因组学部的一名科学家,由Noriyuki Satoh教授领导。Nishitsuji正在努力开发遗传标记,以区分ito-mozuku和它的近亲。

“使用这些标记,我们可以进行杂交育种,”他说。“这是种植陆生植物新品种的一种流行方法,尤其是小麦和马铃薯,但就海藻而言,没有人成功进行杂交育种。”

海洋基因组学部门在Onna Fisheries Cooperative的帮助下进行了他们的研究,该组织位于OIST校园的拐角处。该小组于2006年建立了ito-mozuku的“Onna-1”菌株,并为基因组研究提供了样品。该股计划继续对合作社的样本进行测序,但总有一天,他们希望进一步扩展他们的研究。

“到目前为止,我们计划在冲绳继续我们的'海藻项目',”Nishitsuji说。“如果可能的话,我们希望扩大它以涵盖整个日本。”

褐藻糖胶工厂

与其他棕色海藻相比,如海带(Saccharina japonica)或裙带菜(裙带菜(Undariapinnatifida)),ito-mozuku和冲绳mozuku都是非常丰富的褐藻糖胶来源。之所以可能在他们的基因中编码。

研究人员发现,两种mozuku物种都含有一个融合基因,可以驱动它们的褐藻糖胶生成。这两种基因本身就是两种不同酶的代码 - 促进化学反应的蛋白质,最终有助于产生褐藻糖胶。一旦融合,基因可以同时表达并产生具有两种功能的单一酶。Nishitsuji说,使用双刃酶,mozuku可能会在其他海藻的一小部分时间内抽出褐藻糖胶。

研究人员在ito-mozuku发现了另外一对融合基因,这些基因在冲绳mozuku没有找到。他们预测,当表达时,这些基因可能会增加转移到褐藻糖胶的硫酸基团的数量,这种化学反应可能是该物质对健康有益的关键。该单位计划在未来的研究中对该理论进行测试,因为他们继续从冲绳和大日本的棕色海藻中收集基因组数据。

“土地作物有很长的遗传学研究历史,”Nishitsuji说。“但是没有人在海藻中进行过这种研究。”海洋基因组学部门了解该作物在日本的文化和经济重要性,旨在加快我们对海藻的了解。

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