采集活麋鹿的内脏以了解它们如何分解生物量

反刍动物胃肠道中的微生物如驼鹿有助于将顽固的植物生物量分解为碳营养素，但是当麋鹿饮食改变时，它们如何在季节中这样做，以及涉及哪些微生物?现在，一个国际研究团队研究了活驼鹿瘤胃中的微生物群落，并获得了一个更复杂的微生物食物网的整体观点，该网络负责该生态系统中的碳处理。

分解生物质的微生物在令人惊讶的数量的过程中起着至关重要的作用，包括哪些化学物质释放到空气中以及是否可以形成有用的生物燃料或生物产品。通过了解微生物如何在驼鹿的肠道中处理木质材料如树枝和树皮，科学家们可以更好地预测这些动物的季节性饮食变化如何影响它们分解这些木质材料的能力。然后，他们可以扩展这种理解，以帮助工业中的生物燃料，生物产品和化学加工。

虽然以前的研究使用猎人杀死的动物，但这项研究在野外采集了自由放养的阿拉斯加驼鹿放牧。通过为这些驼鹿配备瘤胃瘘(一个通向其肠道的端口)，该团队可以在消化自然饮食时对动物进行取样。由于社区在春季，夏季和冬季觅食期间积极降解木本植物生物量，因此该努力为居住在这些动物瘤胃中的微生物群落提供了首次访问。

来自俄亥俄州立大学，阿拉斯加大学安克雷奇分校，挪威生命科学大学，丹麦哥本哈根大学，英国纽卡斯尔大学，太平洋西北国家实验室以及阿拉斯加鱼类和游戏部门的研究人员对微生物进行了深入研究。在瘤胃中发挥作用。这项工作利用了使用600-MHz 核磁共振收集的蛋白质和代谢物数据EMSL，环境分子科学实验室的光谱学和从联合基因组研究所JGI通过设施整合用户科学合作计划(FICUS)获得的基因组数据，该团队获得了两个能源部办公室的专业知识。科学用户设施，均由生物和环境研究办公室赞助。

通过结合最先进的酶学方法研究这些丰富的数据，研究人员可以一瞥微生物如何专业化以及如何协调其任务来调节瘤胃内碳的整体“流动”。该分析使代谢洞察成为180个基因组，其中大部分以前是未知的，并解决了病毒在反刍动物消化中施加的低估的影响。他们的努力破坏了社区结构和代谢交接，支撑着这种动物宿主微生物生态系统，其研究结果与农业，人类健康和生物燃料生产相关。