从食品样品中分离细菌病原体DNA

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-03-14 浏览次数:64

为什么科学家需要扩增细菌DNA用于分子鉴定和食源性病原体的血清分型?识别微生物在许多行业中都非常重要,并且通常被视为质量保证,以确保所生产的食品或使用的成分不含有食源性细菌。许多州和国家还要求对特定物种进行检测,例如沙门氏菌,李斯特菌和大肠杆菌。

从食品样品中分离细菌病原体DNA

病原体概览图像

传统上,识别微生物的方法使用差异培养基。这些是需要孵化的固态培养基,有时需要孵育,有时需要长达48小时。这可能导致识别食物样品中可能存在的微生物的严重延迟。使用分子技术,尤其是基于扩增的方法,如终点PCR或qPCR,可以提供更快的结果,从而可以在数小时而不是数天内做出决策。

使用基于扩增的技术(qPCR,WGS)的血清分型也提供了区分特定病原体的亚种的能力。例如,可以使用分子方法区分超过2500种沙门氏菌亚型,提供比传统技术更多的信息。

Promega公司麦克斯韦是怎样® RSC病原套件用于净化细菌的DNA?这与其他技术有何不同?

Maxwell RSC PureFood病原体试剂盒与我们的Maxwell RSC仪器配合使用。这些自动化核酸提取系统使用纤维素磁性颗粒结合粗制样品裂解物中的DNA,然后通过一系列洗涤步骤,在洗脱纯化的DNA以备下游扩增之前,去除任何不需要的抑制剂或材料。

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Maxwell RSC仪器是基于盒式磁带的系统。纯化所需的所有试剂均以易于使用的盒式磁带提供。客户只需将样品添加到墨盒中,将其放入仪器中,然后运行协议。系统自动执行提取,这是与其他技术的主要区别。通过去除与旋转柱和其他方法相关的手动清洗步骤和移液,自动化消除了由于人为错误导致的大部分可变性。

Maxwell RSC PureFood病原体提取方案补充了基于扩增的测试,例如qPCR或NGS,它们需要高质量的纯化DNA。

Maxwell RSC Purefood Pathogen Kit为研究人员带来了哪些优势?这种病原体试剂盒如何工作?

该技术的优点之一是它允许研究人员在一个步骤中溶解革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌。许多其他试剂盒利用酶来消化细胞壁并帮助打破革兰氏阳性细菌。Maxwell RSC Purefood病原体试剂盒中使用的裂解缓冲液化学溶解这些键,使用一步从两种细胞类型中释放DNA。

实验室自动化的使用消除了可变性,消除了与手动技术相关的不一致性。在提取和重复中确保一致性。

最重要的是,通过自动化DNA纯化和确保运行之间的一致性,Maxwell系统可以让科学家们做其他事情,例如准备样品或进行下游分析,从而提高工作流程的效率。

Maxwell Purefood病原体试剂盒比其他病原体试剂盒有哪些优势?

使用差异培养基,进行“富集步骤”,其中将可疑食物材料放置在Stomacher内以允许存在的任何细菌生长。然后将样品置于培养箱中的差异培养基上。此过程需要两天时间才能完成。

使用Maxwell系统,仍然进行过夜孵育富集步骤,但随后的DNA提取是自动化的,并且可以在8小时轮班中完成多次运行。Maxwell RSC仪器可以处理16个样品,Maxwell RSC 48可以在大约一个小时内处理48个样品。

下游qPCR分析可能需要半小时到45分钟。这种自动化允许研究人员在两到三个小时内处理16到48个样本,包括下游qPCR,而不是手动方法所需的两天。

实验室采用更快速的检测方法,以更快的时间框架提供可操作的信息,这一点至关重要。如果担心被污染的原材料或食品会被生产出来,结果可能会迅速返回制造商或实验室,以便能够以最小的延迟做出决定。

可以麦克斯韦® RSC Purefood病原体的试剂盒可以用任何其他产品用于自动化病原体提取和识别的过程?

我们还提供一个名为MaxPrep的系统,该系统可与Maxwell RSC系统一起用于自动化样品制备,标准化和qPCR设置。MaxPrep是一个液体处理程序,具有允许研究人员进行qPCR设置的特定协议。

MaxPrep配有预设协议,因此用户不需要编程不同的步骤。在DNA提取的上游侧,MaxPrep可以进行样品制备和设置。Maxwell RSC或RSC 48的甲板托盘放置在MaxPrep内部,允许整合提取前和提取后的步骤,包括将洗脱缓冲液和样品分配到RSC柱中。

在提取之前和之后使用MaxPrep消除了手动处理的许多难点,并且旨在自动化整个工作流程。

已经提取的任何DNA洗脱液都可以在qPCR或终点PCR的下游使用。如果需要,研究人员还可以使用qPCR或吸光度检测或定量分析物。

除了专业知识,提取方案和仪器,Promega还提供qPCR所需的许多缓冲液和酶。

Promega在使用该病原体试剂盒和仪器时能提供哪些保证?

我们所有的试剂都经过严格的QA标准测试。所有产品都附有分析证书,其中包含所有质量测试的详细信息。

作为一名产品经理,我生活在反馈中,无论好坏,不仅要改进和发展我们现有的产品,还要填补我们目前没有提供的产品的空白。

对于病原体试剂盒,我们早期与行业中的主要意见领袖密切合作,与他们一起了解他们所面临的挑战。他们给了我们一些非常直接的反馈,我们能够在开发过程中将其纳入我们的产品需求中。最终产品是与业界合作的高潮。

您能简单介绍一下Promega,您的工作以及您所服务的行业吗?

Promega产品被生命科学家使用,他们正在询问有关生物过程的基本问题,以及应用科学知识诊断和治疗疾病,检测工业和食品制造过程中的微生物污染,发现新疗法,以及使用遗传学和DNA的科学家测试人体识别。

Promega最初于1978年在美国威斯康星州麦迪逊市成立,在16个国家设有分支机构,在全球100多个国家设有分销商。

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