主要是由于在实验室条件下培养微生物的挑战,人类肠道微生物组中许多物种的基因组序列仍然未知。为了解决这个问题,我们从来自地理和表型多样化的人类受试者的3,810个粪便宏基因组中重建了60,664个原核生物基因组。
这些基因组为2,058个以前未知的物种级操作分类单位(OTU)提供参考点,表示测序肠道细菌的系统发育多样性增加50%。平均而言,新的OTU占每个人丰富度的33%和物种丰度的28%,并且富含来自农村人口的人类。临床肠道微生物组研究的荟萃分析确定了新OTU的多种疾病关联,这些联系有可能改善预测模型。最后,