化学创新药物的整个发展过程可以分为苗头化合物——先导物——候选药物——处方药物,而候选药物的确定是其中最为关键的环节,但也离不开先导化合物结合药效、药代、安全性和物化性质的多维空间优化操作。目前化合物初步筛选时比较流行的依据就是“类药5规则”也称Lipinski规则,如下:
1. <5个氢键供体(HD);
2. <10个氢键受体(HA);
3. MW<500;
4. Log P<5(或者MLogP<4.15),一般认为logP(0~3)化合物的胃肠道吸收最佳,渗透性和溶解度存在良好的平衡。
5. <10个可旋转的键(FRB)。
然而最近获批的新药,从分子量角度来看,很多却不符合该MW<500的标准,如用于子宫肌瘤的GnRHR 拮抗剂Relugolix、治疗慢性免疫性血小板减少症Syk抑制剂Fostamatinib disodium hexahydrate、治疗血小板减少症的TpoR激动剂Avatrombopag Maleate、治疗青光眼和眼压过高的EP2激动剂Omidenepag isopropyl以及恒瑞的乳腺癌新药Pyrotinib Maleate等,且核苷酸类抗病毒药、多肽类药物、激素类药物的分子量往往都是较大的。这让大家看来在获取优秀的ADMET性质时,分子量标准降低。近几年获批药物的分子量呈现增大趋势。随着大分子、生物药的行情高涨,小分子存在感降低,然而看看基药目录,以及纳入医保范围的新药,还是小分子占主要地位。
然而事实上也的确如此,查文献发现,2011年,Walters及其同事整理了50年内批准药物的理化性质,发现早期(1959-1964)批准药物的分子量范围主要为300-360,后随着时间的推移,分子量逐渐增加,至2005-2009获批药物分子量主要为360-440。去年JMC刊了一篇综述《Lead-like Drugs: A Perspective》,作者对2011-2017年FDA和EMA最新批准的新药(分子量>2000的未包括)以及2014年以来美国TOP200的处方药(包括品牌药和仿制药)进行了分子量的调查,见下图。该调查显示,在2011-2016年期间,146种最新批准的药物中有25种(17%)分子量低于典型的300-440范围,有近70(约48%)种药物分子量>440。而在2017年,高分子量药物趋势仍持续存在,FDA批准药物64%的分子量>440,而分子量<300的不足11%。Top200处方药中有160种低分子量药物,其中57种分子量低于300(36%)。Top200处方药物中高分子量的占比才20%。因此也可以看出,小分子量药物的使用目前仍旧是最为广泛的。
其实那篇文献主要是介绍lead-like药物的(或分子量<300),讨论了16个lead-like药物,按照来源分为三类,lead-like筛选产生的,如tavaborole、crisaborole、ataluren;药物化学优化,或者对已知lead-like药物、天然产物衍生的,如lorcaserin、tasimelteon、pomalidomide,以及生物和临床试验(如代谢、天然产物、再利用)努力获得的,如dimethyl fumarate、pirfenidone、Eslicarbazepine Acetate、Teriflunomide、Migalastat。其中不乏药物发现有趣的例子,感兴趣的可以找文献看看。
因笔者最近重看《Drug-like: Concepts, Structure Design and Methods: from ADME to Toxicity Optimization》,且主要侧重于肿瘤药物研发,所以整理了2018年最新在美国、欧盟、日本、中国获批的肿瘤新药中小分子的理化性质情况,以结合学习,在此与大家分享,具体见下表所示。从表中可以看出,游离态发现分子量50%以上分子量在440以上,其他处于300-440,无文献里说的lead-like药物(分子量<300),不过氢键供体都是在5规则范围的,而氢键受体和游离态自由基有少数几个压边,个别相差较远。