知更鸟和海龟鸽子基因组中的鸟类迁徙和保护线索

欧洲知更鸟和海龟鸽子的遗传密码首次由Wellcome Sanger研究所的科学家及其合作者进行测序和组装。今天(12月21日)完成的基因组将使研究人员能够探索控制鸟类迁徙的基因开关，并深入了解有助于知更鸟“看到”地球磁场导航的磁感受器。海龟鸽子基因组将帮助保护拯救英国最快衰落的鸟类之一。

欧洲知更鸟生活在欧洲，俄罗斯和西伯利亚西部。虽然大多数英国知更鸟在冬季居住在英国，但一些鸟类将迁移到南欧以在温暖的气候下过冬。同时在冬季，来自斯堪的纳维亚半岛，欧洲大陆和俄罗斯的移民知更鸟前往英国，以避免家乡的恶劣天气。

龟鸽也会迁徙，前往欧洲的繁殖地，并在非洲过冬。然而，自1995年以来，94%的海龟鸽子已经丢失，英国只剩下不到5,000对繁殖鸽。龟鸽子是英国鸟类最快，下降品种，作为一个结果，他们被列为脆弱的国际自然(IUCN)红色名录的保护。

迁移模式和行为因物种而异，但也在物种内。同样，疾病和有限的食物资源等环境压力也会对各种鸟类产生不同的影响。为了充分了解复杂性状的遗传成分，如迁移和育种，必须阅读和分析整个遗传密码。

为庆祝桑格25周年，桑格研究所及其合作伙伴阅读了欧洲知更鸟和海龟鸽子的基因组。

林肯大学的合作者将知更鸟和海龟鸽子样本送到剑桥附近的桑格研究所。测序团队从样品中提取DNA，并使用PacBio SMRT测序技术生成知更鸟和龟鸽的第一个参考基因组。

欧洲知更鸟基因组将使研究人员能够探索支持迁移的基因开关，告诉知更鸟什么时候离开以及去哪里。知更鸟作为鸟类迁徙模型的作用将有助于了解鸟类眼睛中的磁感受器，使其能够利用地球的磁场进行导航，并解除其他鸟类的迁徙行为。

来自德国普兰马克斯普朗克进化生物学研究所的Miriam Liedvogel博士说：“鸟类可以利用地球磁场作为迁徙过程中的方向参考，鸟类中的磁罗盘首先用知更鸟描述。欧洲知更鸟基因组将使我们能够识别驱动鸟类迁徙的原因，并了解其他鸟类迁徙的变异性。“

龟鸽基因组将为确定有效种群规模和建立育种计划提供遗传参考，以帮助保护这种受威胁的鸟类。

来自林肯大学的Jenny Dunn博士说：“为了让鸽子鸽子成为未来生存的最佳机会，我们首先需要了解影响其种群数量下降的压力。龟鸠基因组将深入了解疾病的方式和有限的粮食资源对其健康的影响，并将有助于实际保护工作，以最大限度地提高引进种群的遗传多样性。“

欧洲知更鸟和乌龟鸽子加入金鹰，成为25种英国物种中的第一种，对其遗传密码进行测序和组装。25个基因组计划包括灰色和红色松鼠，黑莓和褐鳟等物种。

威尔康桑格研究所副主任朱莉娅威尔逊博士说：“基因组测序可以为自然界提供很多东西。遗传信息可以加强对受威胁物种的保护，并帮助解开进化树，理解我们共享的物种星球。“