在人体肠道中发现了近2000种未知细菌

EMBL欧洲生物信息学研究所和威康桑格研究所的研究人员已经发现了近2000种生活在人体内的细菌。这些物种尚未在实验室中培养。该团队使用一系列计算方法来分析全球个体的样本。

发表在“自然”杂志上的研究结果强调，虽然研究人员可能越来越接近创建北美和欧洲肠道中常见微生物的综合清单，但世界其他地区的数据却非常缺乏。

人体肠道是许多微生物的家园，统称为肠道微生物群。尽管在该领域进行了广泛的研究，研究人员仍在努力确定生活在我们肠道中的个体微生物物种，并了解它们在人类健康中扮演的角色。

'重建'细菌

造成肠道微生物群一部分的一些微生物物种长期未知的原因有很多，例如肠道丰度低或无法在肠道外存活。通过使用计算方法，研究人员能够重建这些细菌的基因组。

“计算方法使我们能够理解我们在实验室中尚未培养的细菌。使用宏基因组学重建细菌基因组有点像将所有碎片混合在一起后重建数百个谜题，而不知道最终图像的外观是什么样的， EMBL-EBI集团负责人Rob Finn表示，在从混合物中完全去除一些碎片之后，只是为了让它更难一点。“研究人员现在正处于一个阶段，他们可以使用一系列计算工具来补充并有时指导实验室工作，以便发现对人类肠道的新见解。”

地理多样性

该研究强调了全世界肠道细菌的组成如何不同，以及我们研究的样本对于反映这种多样性的重要性。

“我们看到欧洲和北美人口数据中出现了大量相同的细菌种类，”芬恩继续说道。“然而，我们在这项研究中获得的少数南美和非洲数据集显示出前人群中没有显着的多样性。这表明，如果我们想要真正全面了解其组成，那么从代表性不足的人群中收集数据至关重要。人的肠道。“

人体肠道的蓝图

“计算方法使我们能够了解生活在人体肠道中的许多细菌物种，它们是如何进化的，以及它们在微生物群落中可能发挥的作用，”EMBL-EBI博士后研究员Alexandre Almeida说。惠康桑格研究所。“在这项研究中，我们利用最全面的胃肠道细菌公共数据库来识别以前从未见过的细菌种类。我们使用的分析方法具有高度可重复性，可以在未来应用于更大，更多样化的数据集，从而进一步实现发现。”

“这样的研究正在帮助我们创造一个所谓的人体肠道蓝图，未来可以帮助我们更好地了解人类健康和疾病，甚至可以指导胃肠道疾病的诊断和治疗，”集团负责人Trevor Lawley总结道。在惠康桑格研究所。