研究资源标识符可改善生物医学研究中细胞系的正确使用

根据eLife今天发表的一项研究，使用研究资源标识符(RRID)有助于减少生物医学研究中细胞系的不当使用。研究结果表明，在科学文献中继续使用RRID 可以更好地报告出版物中的细胞系和其他研究材料，从而有助于未来的重复性工作。

细胞系广泛用于生物科学。它们无限繁殖的能力意味着科学家在理论上可以完全复制以前的研究并在结果的基础上进行。但错误标记或错误处理可能导致有问题的细胞系的错误识别，污染和/或分布，这反过来又会影响研究数据的有效性。

“RRID应该有助于减少这种细胞系的不当使用，”共同第一作者Zeljana Babic解释说，他是美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校生物系统研究中心的研究生。“这些独特的标识符可以包含在研究论文的方法部分中，以定义细胞系，抗体，转基因生物或使用的软件。它们可以提醒研究人员注意标记有问题的细胞系的资源，例如Cellosaurus数据库。”

“Cellosaurus数据库是细胞系中最全面的知识资源，”日内瓦大学教授，瑞士生物信息学研究所组长Amos Bairoch说。“细胞系的RRID由此权威数据库创建。”

国际细胞系认证委员会(ICLAC)主席Amanda Capes-Davis补充说：“错误鉴定的细胞系是科学文献中的一个主要问题。如果研究人员在发表细胞系之前对其进行错误识别，他们是否还会报告来自这种细胞系的数据?“

在他们的研究中，该团队使用自然语言处理算法来文本挖掘PubMed Central中约200万篇科学论文的方法部分。他们使用该算法识别包含RRID的文章和列出细胞系的文章，然后比较这两个样本中错误识别的细胞系出现的频率。

他们在150,459篇文章中确定了305,161个独特的细胞系名称，并估计其中8.6%属于有问题的细胞系列表。另一方面，包含RRID的634篇论文中只有3.3%的细胞系存在问题列表中。这表明使用RRID与较低报告的有问题细胞系的使用相关。

“但在解释这些结果时我们必须谨慎行事，”资深作者Anita Bandrowski解释说，他是加州大学圣地亚哥分校生物系统研究中心SciCrunch和项目主管的首席执行官。“在有问题的清单上使用细胞系不会自动意味着给定的生产线使用不当。此外，该清单还包括标有错误癌症类型的细胞系，但如果使用的话仍可安全使用研究人员知道这条线的真实身份。“

该团队补充说，重要的是要审查调查结果所依据的证据，并对其对已发表工作的影响做出深思熟虑的判断。“细胞系资源，如Cellosaurus和ICLAC登记的错误识别的细胞系，已被开发用于提高对细胞系信息的认识，”Bandrowski总结道。“我们希望包含RRID将改善这些资源的使用，并在未来的出版物中更好地报告所有研究材料。”