环状RNA有望成为癌症生物标志物

随着新技术允许研究人员深入研究基因组和外显子组，一类称为环状RNA的新RNA可能起到一个有趣的作用。

密歇根大学罗杰尔癌症中心的研究人员对多种癌症中的环状RNA进行了编目，并进行了初步研究，表明这些稳定的结构可以作为血液或尿液中的癌症生物标志物。

环状RNA是一种非编码RNA，其形成闭合的环状结构而不是线性结构。新的RNA测序方法使这些方法变得清晰，对它们起作用的原因或方式知之甚少。但它们的稳定结构使其成为开发癌症生物标志物的理想候选者。

该研究发表在Cell上，确定了癌症中circRNA的概要，为未来研究创建了一个数据库。

“我对环状RNA作为非侵袭性生物标志物的潜力感到非常兴奋。由于它们的稳定性，我们可能能够在癌症患者的血液或尿液中检测到这些。这可能对癌症的诊断或预后有用，” Arul M. Chinnaiyan，医学博士，博士，密歇根医学中心转化病理学中心主任和SP希克斯病理学教授。

研究人员从超过800个肿瘤样本中发现了circRNA，作为MiONCOSEQ计划的一部分。他们证明了为MiONCOSEQ开发的捕获RNA测序在检测circRNA方面比现有方法更强大。

“捕获方法可能有限，因为它基于我们用于捕获RNA的探针。但整个外显子组捕获方法使其显着。我们以这种方式捕获大量RNA。这就是为什么我们能够提名如此多的circRNAs以前不知道，“Chinnaiyan说。

该技术仅需要少量总RNA即能鉴定circRNA。这意味着它可以在稀释RNA的地方检测到，例如血液或尿液。

此外，该团队还发现了几种在前列腺癌组织中发现的circRNA。通过评估来自前列腺癌细胞的circRNA，他们发现它们比线性RNA更稳定。它们也可以在尿样中检测到。

“我们能够证明这些circRNA存在于尿液中并且可以检测到来自前列腺癌的那些。我们未来的研究将探索这些circRNA作为尿液或血液癌症生物标志物，”Chinnaiyan说。

研究人员将他们的研究结果转变为一个名为MiOncoCirc的数据库，对来自肿瘤样本的报告的circRNA进行编目。该资源可供其他研究人员使用，以帮助开发新的癌症生物标记物。