同时研究细菌和宿主细胞的小RNA的技术揭示了两种转录物谱的变化

(Phys.org) - 来自德国，奥地利和美国的一组研究人员发现，使用一种允许在感染期间研究细菌和宿主的小RNA的技术，可以揭示两者的转录谱的变化。他们 在他们发表在Nature杂志上的论文中，该团队描述了他们的技术，为什么它有助于更​​多地了解细菌感染的工作原理以及他们在研究中发现的内容。Matthias Machner和Gisela Storz与Eunice Kennedy Shriver国家儿童健康与人类发展研究所合作，就该团队在同一期刊上所做的工作提供新闻和观点。

正如Machner和Stortz所指出的那样，为了更好地理解当细菌感染宿主时发生的事情，大多数先前的研究都集中在细菌或宿主中的信使RNA上。在这项新的努力中，研究人员使用了一种技术，可以同时关注两者，从而可以更全面地了解感染过程的初始阶段和后期阶段发生的情况。

这种称为双RNA-seq的方法允许研究人员同时研究宿主转录物和病原体信使RNA - 在这种情况下，沙门氏菌感染人类细胞系。更具体地，他们专注于称为PinT的小RNA，已知当细菌开始感染宿主细胞时其被激活。仔细观察发现它还调节了肠道沙门氏菌基因并显示出影响宿主转录模式的迹象，这反过来导致一些长的非编码RNA的变化和宿主细胞中其他信号传导途径的激活。

研究人员解释说，双RNA-seq是一种方法，它使用绿色荧光标记细菌，以便在宿主细胞被感染时识别它们的部分。该技术允许在感染进展时研究来自两种生物体的信使RNA和非编码RNA的转录物，提供前所未有的过程视图。他们还注意到他们的研究还表明，感染过程中的微小变化如何传播到宿主系统，可能导致受感染宿主的不同结果。