研究人员经常分析试管中的分离生物分子,结果是否适用于密集细胞是值得怀疑的。来自Bochum,Dortmund和Greifswald的团队监测活细胞中RNA结构的折叠,并将结果与试管分析结果进行比较。研究小组在三种不同情况下研究了微生物沙门氏菌的RNA结构的行为:活细胞 ; 在没有添加剂的水溶液中 ; 并且在含有各种添加剂的水溶液中,这些添加剂被认为是模拟细胞中的分子。
人工添加剂影响RNA行为
基于添加剂的化学组成,以及其浓度和大小,试管中的添加剂影响RNA分子的行为。考虑到这些结果,研究人员预计活细胞中的RNA分子 - 其密集地包裹着各种分子 - 在水溶液中表现出与RNA分子不同的行为而没有任何添加剂。
“令我们惊讶的是,我们没有发现活细胞和稀释水溶液之间的平均差异,”波鸿鲁尔大学物理化学系II的初级教授Simon Ebbinghaus博士说。期刊“ Angewandte Chemie ”和“ Angewandte Chemie国际版 ”,以及生物系的RUB同事,多特蒙德大学和格赖夫斯瓦尔德的恩斯特莫里茨阿恩特大学。
细胞和稀释的水溶液没有区别
“因为它含有大量的大分子,细胞环境高度集中且粘稠,类似于我们使用人工添加剂模拟的那种,”Ebbinghaus解释道。“然而,与人工添加剂不同,细胞环境似乎只能略微改变RNA的稳定性。”在研究过程中,研究人员分析了一种具有发夹结构的RNA温度计。在更高的温度下,结构熔化,从而引发微生物的热冲击响应。结构末端的颜色标记使研究人员能够监测发夹是否在不同条件下展开。
活细胞中RNA稳定性的强烈波动
在活细胞中,RNA温度计的稳定性比试管中的稳定性强得多。研究人员怀疑,细胞环境的动态变化可能会不断影响RNA的折叠。因此,细胞环境可能构成调节和调节各种生物过程的关键因素。