家畜中常见的病毒依赖于微RNA进行复制

在病原体病毒和它们感染的细胞之间正在进行的军备竞赛中，每一方都需要它可以获得的每一个优势。狡猾的病毒可以通过颠覆其宿主的microRNA(miRNA)来获得支持。这些miRNA是由宿主细胞制备的小片段RNA，用于调节基因表达。如果一种病毒可以选择一种病毒，它可以操纵它的宿主，而不必自己制造蛋白质。这种策略可以节省病毒基因组中的宝贵空间，并使病毒更好地躲避宿主的免疫系统。

已知DNA病毒利用它们感染的细胞的miRNA; 他们甚至自己生产。去年，洛克菲勒的科学家们惊讶地发现丙型肝炎是一种含有RNA而不是DNA 的病毒，它不仅可以隔离宿主miRNA，还可以依赖它。现在是同一个团队 - 其中包括Charles M. Rice，Maurice R.和Corinne P. Greenberg教授，病毒学和传染病实验室负责人以及Robert B. Darnell，Robert和Harriet Heilbrunn教授和实验室的研究人员。分子神经肿瘤学实验室负责人已经发现另一种RNA病毒，牛病毒性腹泻病毒，感染奶牛和其他家畜，也依赖于miRNA感染。他们的结果报告在Cell Host&Microbe中。

一种新的测量技术

为了研究HCV以外的RNA病毒是否使用宿主miRNA，研究人员开发了一种筛选方法，将这些miRNA化学附着到其靶标上。“生物信息学搜索miRNA靶标的问题在于它们足够小，可以在转录组中每隔几千个碱基发生，”该研究的第一作者，现在在哥本哈根大学的Troels Scheel说。“此外，计算方法通常不知道在不同细胞类型中表达的是什么”，因此它们鉴定为miRNA靶标的mRNA序列可能是生理学相关的。

相比之下，Darnell和Rice实验室开发的生化扫描称为CLEAR-CLIP-通过将miRNA与其某些靶mRNA物理连接来鉴定真正的miRNA靶序列，而无需任何先验序列信息。

“HCV是一个异常值吗?它对miRNA的依赖性是独一无二的吗?” 想知道赖斯Luna，赖斯实验室的博士后。为了找到答案，他和他的同事使用CLEAR-CLIP分析了15种RNA病毒与其宿主miRNA的相互作用。其中有几种已知会引起人类疾病的病毒，包括脊髓灰质炎病毒，登革热和基孔肯雅病毒。他们的分析表明，牛病毒性腹泻病毒，或BVDV，一种在肉类和乳制品行业中造成重大麻烦的瘟病毒，特别是与miR-17和另一种称为let-7的宿主miRNA结合。

BVDV依赖于miR-17，并且还可以补充它

通常，miRNA通过抑制基因的表达或其翻译成蛋白质而起作用。但在这种情况下，miR-17稳定BVDV基因组，就像miR-122对HCV一样。在感染宿主后，病毒通过改变其基因的表达来控制它。由于BVDV可以清除宿主细胞的miR-17，因此可以防止这种miRNA通常在其控制下抑制宿主基因。

科学家发现它们可以通过抑制病毒与miRNA的相互作用来削弱病毒的复制和产生。他们说miR-17可能为开发控制BVDV的新药提供有效的靶点。

在报告中，研究人员推测，对宿主miRNA的依赖可能是瘟病毒复制的一般现象，尽管他们还不确定它可以起到什么样的生物学作用。但无论其功能如何，瘟病毒和miRNA之间的这种相互作用可能为抗病毒治疗提供成熟的靶标，因为病毒复制取决于它。