了解细菌的起源和传播可以预防疾病

鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhimurium)DT104是一种侵袭性细菌，特别成问题，因为它已经产生了对许多抗菌药物的抗性并且能够迅速传播到世界各地。利用新技术，丹麦技术大学国家食品研究所已经能够将细菌追溯到其起源，并在其产生抗药性时进行研究。该技术可用于监测新的细菌菌株，预防并且至少了解传染病。

沙门氏菌是导致全球食源性疾病最多的食源性细菌之一。S. Typhimurium DT104变种是研究最多的变种之一，因为它具有很强的侵袭性，并且迅速传播到世界各地。直到最近，人们才知道它何时起源或者它是如何传播的。

就像警方在新技术的帮助下突然解决感冒病例一样，国家食品研究所的研究人员使用全基因组测序，发现DT104起源时和细菌对常见抗菌药物产生耐药性。在全基因组测序中，同时映射致病微生物的整个DNA谱。

细菌的家谱

在该研究中分析了来自人和动物的总共315个样品。这些样本是在1969年至2012年间在六大洲的21个不同国家收集的。通过检测DNA中随时间发生的突变，科学家们构建了细菌的家谱 - 一种所谓的系统发育树。

根据系统发育树，研究人员估计DT104起源于1948年，来自一个不明来源，并在1972年它产生了对许多抗菌药物的抗性。该分析还揭示了细菌的全球传播途径以及它如何在动物物种和人类之间传播。

猪根除的证据

1996年为了在丹麦猪群中根除DT104，丹麦为感染DT104的牛群推出了一项卫生计划。该计划要求必须移除动物，并且必须彻底清洁和消毒建筑物，然后再用不含DT104的猪重新填充。

卫生计划于2000年停止，因为没有证据表明它正在运作。然而，国家食品研究所的研究表明，猪的DT104在1999年和2000年的患病率急剧下降，从而证实该计划具有巨大的预期效果。

监督和预防

利用研究结果，研究人员可以反驳关于DT104进化的几个假设。他们提倡全基因组测序用于帮助我们更好地了解过去，以便这些知识可用于解决当前抗菌素耐药性的问题，并且该技术可用于监测新的细菌变异以防止新的感染疾病。