几十年来,研究DNA的序列和功能一直是生命科学的焦点,但现在许多研究人员的兴趣转向了RNA。今天,许多科学家认为RNA分子与各种不同的蛋白质在几乎所有细胞过程中都起着调节或结构作用。然而,这些RNA-蛋白质相互作用的机制仍然很大程度上未知。来自柏林马克斯普朗克分子遗传学研究所的一组科学家现已成功鉴定出数百种与人体细胞核内的RNA分子相互作用的蛋白质。研究人员展示了人类细胞核的第一个RNA相互作用组,并描述了他们如何使用他们新开发的方法“识别人类细胞核中的大部分RNA结合蛋白”。
几十年来,蛋白质一直被认为是活细胞中的主要功能成分。然而,近年来,它们对细胞过程的至关重要性已经与关于RNA分子参与的日益增长的知识相媲美。信使RNA(mRNA)和转移RNA(tRNA)形状的RNA被认为仅仅作为携带遗传信息的DNA和作为细胞构建块的蛋白质之间的介体。但是现在已经证明,除了作为基因组信息的信使之外,RNA还介导了其他几种功能。RNA的这些非编码功能包括调节基因转录和蛋白质的任务生产以及确定细胞内其他分子的位置。因此,阐明蛋白质和RNA之间的相互作用对于理解生物体发育的分子机制和疾病的出现至关重要。
由柏林马克斯普朗克分子遗传学研究所的UlfAnderssonØrom领导的研究小组现在首次概述了人类细胞核中RNA分子和蛋白质之间的众多相互作用。为此,科学家们不得不首先修改用于分析RNA-蛋白质相互作用的“RNA interactome capture技术”,以便他们可以用它来识别细胞特定区室内的RNA-蛋白质相互作用,例如细胞核。通过改进的方法,研究人员研究了总共10亿个细胞的细胞核,以捕获和记录细胞核中所有可能的RNA-蛋白质相互作用。
“我们特别感兴趣的是,许多发现的RNA结合蛋白不仅控制基因的活性和所得RNA分子的命运,而且还参与受损DNA的检测和修复”,Ørom解释说。由于活性氧物质,紫外线辐射或其他外部或内部刺激,可能发生DNA损伤,例如假的或缺失的碱基或DNA双螺旋的一条或两条链的断裂。DNA损伤每天在体内的每个细胞内发生数千次。细胞以复杂的修复过程作出反应,该过程涉及特异性修复受损DNA的许多蛋白质和RNA 分子,从而维持细胞的功能。
“一段时间以来,人们一直怀疑RNA在修复受损DNA中的作用,但RNA对这一过程的影响仍然未知”,Ørom说。“通过鉴定将RNA与DNA损伤反应联系起来的蛋白质因子,本研究有助于更好地理解这些机制。” 科学家希望他们的发现将有助于更好地了解人类疾病的出现和抗癌新疗法的发展。