研究人员对橡胶树的真菌内生菌进行了测序,并将其基因组与36种其他真菌进行了比较,重点关注对宿主 - 真菌相互作用至关重要的基因。内生菌存在于活的植物细胞内,不仅可以在植物健康中发挥作用,而且可以在碳和氮循环中发挥作用。了解内生生活方式的演变可以帮助研究人员了解植物和真菌如何形成共生关系,以及共生关系如何为寄主植物提供有益的特性。
内生菌是非常常见地存在于活植物细胞内而不伤害其宿主的生物,并且实际上通常对其生存和生理有显着贡献。内生真菌的演变和它们与宿主相互作用的机制仍然知之甚少。为了深入了解这些问题,包括美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)研究员,美国能源部科学用户设施办公室和克拉克大学长期合作者在内的研究小组对Xylona heveae的基因组进行了测序,这是一种内生菌。秘鲁橡胶树,然后将其基因组与子囊菌门内36种相关真菌的基因组进行比较。
基于37个真菌基因组的数据集,其中三分之一在DOE JGI进行测序和注释,该团队发现内生菌如X. heveae,以避免触发其植物宿主的免疫系统,通过减少其CAZymes进行调整,编码碳水化合物活性酶的纤维素降解基因。与此同时,真菌内生菌似乎也扩大了可以提高其在宿主植物细胞间隙内存活机会的酶数量。
作者认为,在适应宿主的过程中,X。heveae已经降低了木材降解能力,以至于它可能无法转换为不同的生活方式,也不会致病。他们还提出这种真菌内生菌可以通过昆虫传播。该报告发表在2016年1月的Fungal Biology上。