NIH对导致危及生命的肺炎的真菌的基因组进行测序

美国国立卫生研究院临床中心的研究人员与校外组织合作，对人类，小鼠和大鼠肺孢子虫几乎整个基因组进行了测序。该生物体在免疫抑制的宿主中引起危及生命的肺炎。肺孢子虫是最初导致最初认识到艾滋病毒/艾滋病流行病的感染之一。它在过去30年中导致数千人死亡，并且仍然是艾滋病毒/艾滋病人群以及移植受者和其他免疫抑制患者的重大风险。调查结果发表在Nature Communications上。美国国立卫生研究院的科学家与Broad研究所和Leidos公司的研究人员合作。

通过对基因组的分析，研究人员现在可以更好地了解有机体的生存地点以及它如何避免宿主免疫系统的消除。高质量的基因组不仅允许鉴定对生物体的生长和存活至关重要的代谢途径，而且还认识到在肺孢子虫中不存在其他密切相关的真菌中存在的大量途径。随着肺孢子虫进化成高度依赖其哺乳动物宿主以维持生存，这些途径可能消失。

“我们的长期目标是更多地了解人类肺孢子虫感染，并减少其对免疫抑制人类的影响。这项研究是朝这个方向迈出的重要一步”，高级研究员兼获得性免疫缺陷综合症科主任Joseph Kovacs说。 NIH临床中心重症监护医学部。

“拥有基因组信息有助于我们认识到肺孢子虫的不寻常生物学以及它与哺乳动物宿主的共存方式。它还让研究人员深入了解为什么到目前为止他们无法在实验室文化中重复生长有机体，”梁说。 Ma，MD，美国国立卫生研究院临床中心重症监护医学系的科学家和该论文的第一作者。

该研究已经绘制出比以往任何研究更清晰的基因组图谱。该团队的努力已经产生了高质量，接近染色体的草图基因组，这是基因组作图的最高水平。对存在或缺失的基因的详细描述应该有助于培养生物体，这是肺孢子虫研究中的一个关键里程碑。培养可以允许筛选大量药物，以加速鉴定肺孢子虫肺炎的新疗法，并可能允许遗传操作修饰个体基因，并观察它们对生物体生长及其对宿主的有害影响有何影响。