三文鱼基因组合作发表在Nature上

SFU教授Willie Davidson是国际研究团队的一员，为基因组进化提供了新的视角。研究人员建立了大西洋鲑鱼基因组的“人类”质量序列，现在可以在线获得。他们的作品已在着名的自然杂志上发表。据研究人员称，大西洋鲑鱼基因组大小为2.97千兆碱基，在29条染色体上含有37,000个基因，其大小与人类基因组相似。这项最新工作意味着为人类开发的技术可应用于世界各地的野生和养殖鲑鱼。

“大西洋鲑鱼的基因组已经能够对虹鳟鱼基因组进行改进，并为其他鲑鱼的基因组测序和组装提供了框架，例如Coho鲑鱼和北极红点鲑，”SFU分子生物学系教授Davidson说。和生物化学。“大西洋鲑鱼基因组的完成使这个物种能够在驯养动物(例如牛，羊，猪，鸡)旁边占据一席之地，这些动物的基因组正常用于增强牲畜生产。”

该团队描述了一个全基因组复制(WGD)事件或突变，发生在8000万年前，鲑鱼系列中的第四个，并研究了鲑科鱼类基因加倍的独特能力的影响，使它们能够大大扩展基因与环境的相互作用。

虽然他们发现鲑鱼基因组在一段基因组不稳定之后又回到了原始阶段，但今天仍然存在一些重复的痕迹。“大西洋鲑鱼基因组提供了对红倍体化的见解”是Davidson与维多利亚大学Ben Koop博士合作的结果，该项目是加拿大，智利和挪威专家参与的国际项目的一部分。该项目得到了大西洋鲑鱼基因组序列国际合作组织(ICSASG)的支持。

该研究提供了参考基因组序列和基因图谱，为70多种经济，文化和环境重要的鲑鱼物种提供了一个全新的科学基线，可用于改进和理解渔业，保护，生态学，生理学，进化和水产养殖。

已发表的研究报告确保只需点击鼠标即可获得鲑鱼基因以及可持续农业和野生鲑鱼管理的机会。

“该出版物证明了ICSASG的成功合作关系：他们揭开了该物种基因组的极端复杂性，产生了大量新知识并解决了许多技术障碍”，英国Genome公司总裁兼首席执行官Alan Winter博士说。哥伦比亚。“此次合作留下了一项遗产，将有利于加拿大，挪威，智利和其他国家未来几年对这一经济和环境重要物种的研究和可持续发展。”