根据由基因组分析中心(TGAC)领导的一项新研究,犬类基因组的非编码RNA是研究人类疾病的重要模型,是进化和生物医学研究的重要起点。今天在PLOS ONE上发表的一项新研究揭示了狗基因组中microRNAs的改进注释,以进一步了解其生物学作用。为将来研究生物医学,进化和重要动物(包括狗,牛,马和猪)的驯化提供平台。
微小RNA(miRNA)是小的非编码RNA分子,其在调节动物和植物中的基因表达中起关键作用。使用最新的狗基因组装配和九种不同狗组织的小RNA序列,包括皮肤,血液,卵巢和睾丸,来自TGAC的科学家已经鉴定出91种新型miRNA。
这一发现提供了一个重要的机会,不仅可以增强我们对miRNA如何调节用于研究人类疾病的重要模型物种中的各种生物过程的理解,而且可以导致进一步的类似研究miRNA在动物驯化中的作用。来自TGAC脊椎动物和健康基因组学的首席研究员Luca Penso Dolfin博士说:“由于miRNA在编排各种细胞过程中非常重要,因此发现这91种新型miRNA是探索其潜在重大影响的重要起点。基因调控。“
总体而言,Penso-Dolfin博士分析了811个miRNA:91个新的microRNA序列和720个保守的(即,对其他生物共有)。在这些保守的基因座中,207个先前未被鉴定为犬microRNA。
Penso-Dolfin博士补充说:“我们的结果代表了我们对狗基因组知识的明显改善,为进一步研究基因调控的进化以及microRNA对病理状况的贡献铺平了道路。我们现在正在寻找额外的狗和各种农场动物的数据,将microRNA发现与其在驯化中可能发挥的作用的研究结合起来。“
家犬Canis familiaris是狼(Canis lupus)驯化的结果,它起源于大约1万年前。从那以后,人工选择了数百种犬种,导致形态和行为变异程度非常高。自从狗出现以来,它与人类共享环境,已经暴露于类似的病原体,因此代表了人类疾病研究的重要模型系统。
最新的Canine基因组构建和注释的发布,CanFam3.1提供了一个机会,可以增强我们对狗模型系统中组织间基因调控的理解。