早期发散真菌的基因组序列有助于追踪白腐真菌的起源

研究人员利用代表早期发散组的10种白腐病和褐腐病真菌的草图基因组序列来帮助完善木质纤维素分解的酶起源的时间表。真菌是植物材料的天然降解物，含有生物燃料研究人员希望用于商业应用的酶。通过研究白腐病和褐腐真菌基因组序列中的酶家族，研究人员可以填补真菌进化时间线的空白，并为各种物种获得分解植物细胞壁中所有木质成分的能力提供更精确的时间戳。

生物燃料研究人员对木材腐烂真菌感兴趣，因为它们的酶可以分解植物材料，如纤维素，半纤维素和木质素。褐腐真菌通常被描述为只能分解纤维素和半纤维素的那些，而白腐真菌可以分解所有植物细胞壁成分 - 纤维素，半纤维素和木质素。

现有的各种真菌基因组序列也证明了真菌所采用的木材腐烂策略的广度 ; 例如，虽然一些真菌可能以与白腐病相同的方式分解植物物质，但它们缺少一些通常与白腐真菌相关的基因家族。在2016年4月出版的“ 分子生物学与进化”杂志上发表的一项研究中来自美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)的研究人员，DOE科学用户设施办公室，与法国国家研究所INRA和马萨诸塞州克拉克大学的合作者，在10种真菌的帮助下进行了比较基因组学分析。由DOE JGI测序，组装和注释，以便更好地重建木质素降解真菌酶的来源。

这项工作建立在2012年科学研究的基础上，DOE JGI和克拉克大学的研究人员提出，大约3亿年前白腐真菌的演化恰好与成煤石炭纪时期结束，影响了全球碳循环。该分析不包括几组早期分化真菌的基因组序列，其中一些包括暗示白腐病进化甚至可能更早发生的物种。

随着草案基因组现在代表早期发散的真菌，更精确的分析显示“白腐真菌使用的大部分氧化酶多样性已经出现在第一个白腐病种的起源之后”，这一发现增加了对早先的报道。除了澄清真菌生物质降解酶进化之外，这些额外的真菌基因组还鉴定了生物能研究人员可能感兴趣的其他候选降解酶。