大象内皮疱疹病毒4的完整基因组测序

大象内皮药物疱疹病毒4的完整基因组，称为EEHV4(Baylor)，已被贝勒医学院和约翰霍普金斯医学院的研究人员测序，揭示了这种特殊种类的大象内皮疱疹病毒的独特特征 - 这导致了致命的在管理式护理和自由放养环境中影响亚洲大象的疾病。

该研究结果发表在美国微生物学会的mSphere当前版本中。“这种疾病的致命形式主要与EEHV1有关，但是更温和的疾病是由EEHV5或EEHV4引起的，其中已知的较少，”贝勒博士分子病毒学和微生物学副教授Paul Ling博士说。“在这里，我们已经确定了完整的基因组DNA序列，由Baylor的人类基因组测序中心完成，这是一种EEHV4物种，它是从患有EEHV4后从幸存的亚洲象小牛采集的树干洗涤样本中获得的。”

这只特殊的小牛是休斯顿动物园受监测群体的一部分，该动物园受益于动物园，贝勒，约翰霍普金斯和华盛顿国家动物园之间的研究合作，研究EEHV。该团队开发了一种快速诊断测试，可以定期进行血液和躯干清洗。

由于这些筛查，研究人员发现，牛群中的一些大象经历了不同种类的EEHV(包括EEHV4)的连续轻度感染。“很可能牛群最终会感染多种EEHV物种和亚型，因此了解分子组成并更多地了解不同物种之间的遗传关系将提供可能导致控制疾病的信息，”Ling说。

研究人员已经对EEHV1A，EEHV1B和EEHV5进行了测序。在EEHV4(Baylor)中，他们发现了25个新的或缺失的基因 - 一些存在于EEHV4(Baylor)中但不存在于其他基因中，以及存在于其他基因中但在EEHV4(Baylor)中缺失的基因。

鉴定的另一个特征是存在26个旁系同源的跨膜蛋白家族的旁系同源物(来自同一基因)成员。有关这些发现的更详细描述可以在随附的手稿中找到，该手稿目前也在mSphere中发布。

研究人员还能够确定这种病毒物种的两种不同亚型的存在，称为EEHV4A和EEHV4B。

“仍然存在围绕EEHV致病性的问题，需要更多的研究，”约翰霍普金斯大学医学院的Gary S. Hayward博士说。“一旦更好地理解了许多物种及其各自亚型的发病机制差异，所有基因组类型的序列和基因内容的详细比较将有望为将来的诊断，评估和潜在的疫苗或抗病毒诊断方法提供重要和有用的信息。 ，治疗和控制EEHV相关疾病。“

这是该组测序的第二个完整的EEHV基因组，另一个是2013年的EEHV1A(Kimba)。

参与这项研究的其他人包括：Simon Y. Long，Sarah Y. Heaggans，以及约翰霍普金斯大学医学院; Angela Fuery，彭荣生，贝勒医学院; Xiang Qin，Kim C. Worley，Shannon Dugan，