众包平台使公共基因表达数据更易获取

来自美国国立卫生研究院的国家过敏和传染病研究所(NIAID)的科学家开发了一个免费的在线平台，该平台使用众包方法使生物医学研究人员更容易获得公共基因表达数据，而无需计算专业知识。他们在6月20日的Nature Biotechnology在线期刊中描述了名为OMics Compendia Commons(OMiCC)的平台。

公共数据库包含数百万个基因表达谱 - 描述基因在某些条件下开启或关闭程度的数据。科学家可能会重复使用这些数据来生成和解决新的研究问题。例如，研究人员可以重新设计一个数据集，比较来自药物治疗和未治疗人群的血液样本，以调查性别对治疗的影响。然而，由于许多生物学家缺乏数据检索，处理和分析所需的计算机编程专业知识，因此这些大量信息在很大程度上仍未被开发用于此类数据重用。此外，公共数据库条目通常包含原始研究数据，需要对其进行分析以进行分析。

OMiCC旨在利用众包技术利用研究界的专业知识来克服这些挑战。在平台内，用户可以创建基因表达数据组，并通过使用标准化词汇表分配参数(例如样本类型和疾病)来“注释”它们。OMiCC保存这些用户创建的组和关联的注释，使其他人可以重复使用。

在OMiCC中，用户可以汇集这些数据组并分析来自多个研究的信息以搜索生物关系，这种统计方法称为荟萃分析。NIAID科学家预计，随着OMiCC用户社区的发展，该平台将发展成为一种丰富的资源，可以将越来越多的公共数据转化为新的生物学见解。