生态学家编制了巨大的土壤真菌数据库

森林生态学家Justine Karst是一个重要新资源的合着者 - 世界上最大的研究数据库，分析菌根真菌如何影响植物生产力。这不仅对她的领域很重要，而且因为数据库正在一个开源场所发布，可供所有人(包括世界各地的科学家)使用。

“可以让其他研究人员和公众更容易获取数据，”可再生资源部助理教授卡斯特说。“在开源场所共享数据促进了数据的重复使用，重新解释和质量检查。数据变得无障碍。通过在科学数据等期刊上发布数据，共享数据的人也因此而获得信誉。一些授权机构是现在需要对出版物进行开放访问，这似乎在许多学科中都有发生。“

直到最近，规范是这样的：在他们的研究过程中，科学家收集数据并将其存储在他们的办公室。为了发表论文，他们总结了数据，但将其留在了存储中。如果其他研究人员对使用原始数据感兴趣，他们将逐一联系科学家并协商其使用。

“它耗费时间，并留下了大量数据，这些数据无法用于后续研究，测试新问题，进行重新分析，”Karst说。它还允许不一致的质量检查和创建冗余研究。在森林生态学中，获取植物如何响应菌根真菌(即生活在树根上的有益真菌)的数据尤为重要。

植物与菌根真菌形成的地下关联是地球上最普遍和最古老的共生关系之一。真菌提供营养和水，以换取植物来源的糖。但科学家们对这种关系对生态系统如何运作的影响知之甚少，而且对植物与真菌之间的关系几乎没有广泛的概括。

新的数据库揭示了这一点，尽管它只处理了世界上存在的450,000种植物中的351种植物。

该数据库包括来自438篇经同行评审的文章的4,010项研究，其中包含了各种植物物种在接种真菌时的表现与未吸附时相比的数据。这些数据现在可用于未来的研究，例如旨在综合结果的荟萃分析(分析分析)。“这有效地增加了你的样本量，”卡斯特说。

此外，该数据库包含显示植物之间和真菌之间的进化关系的系统发育(家族树)。“这些数据是在许多物种和实验中收集的，”卡斯特说。“释放数据有助于研究人员定量评估影响植物结果的生态因素，以接种菌根真菌。”

除了应用于恢复和保护管理项目，以及教学生如何进行荟萃分析，卡斯特说数据还有其他价值。“有可能寻找共生生物功能的一般趋势，以及动物和微生物之间的其他共生关系。”

该数据库名为MycoDB，可在Dryad Digital Repository中找到。

它代表了10年来最相关的研究，共有80名合作者完成，其中包括芝加哥的主要作者Bala Chaudhary以及远在厄瓜多尔和泰国的研究人员。