研究人员对glut烟草天蛾的基因组进行测序

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-01-17 浏览次数:116

一个国际研究小组对烟草天蛾的基因组进行了测序 - 烟草天蛾是许多研究实验室用于昆虫生物学研究的毛虫。康奈尔大学Boyce Thompson研究所的Gary Blissard教授和堪萨斯州立大学的Michael Kanost教授发起了这项研究,并且是这个大型国际项目的共同高级作者,该项目包括来自50个机构和11个国家的114名研究人员。

研究人员对glut烟草天蛾的基因组进行测序

研究人员已经在题为“来自的基因组序列草图多方面的生物见解的论文发表了他们的工作烟草天蛾蛾,烟草天蛾在期刊” 昆虫生物化学与分子生物学。科学家通过国家农业图书馆和国家生物技术信息中心(NCBI)向公众提供了基因组序列。

“该项目的完成标志着昆虫生物化学和分子生物学研究的一个重要里程碑,因为Manduca sexta是一种重要的模式昆虫:几十年来一直在研究其生理学和生物化学,”Blissard说。“这个项目代表了全世界多年的合作研究,”Kanost说。“我们希望向科学家提供这些有价值的数据,我们希望这个测序的基因组能够刺激昆虫分子研究的新研究。”

烟草天蛾(Manduca sexta)发育成卡罗莱纳州的狮身人面像蛾。Manduca这个名字来源于贪吃的拉丁语,因为这些毛毛虫吃得太多了。M. sexta在北美洲,中美洲和南美洲自然发生,并且是园丁的已知害虫:它吃番茄植物的叶子,也可以在胡椒,茄子和马铃薯植物上找到。来自这个植物家族的农作物和杂草,包括烟草,产生的化学物质如尼古丁,阻止了大多数昆虫的摄食,但不是M. sexta,这使得它的生理学对科学家来说特别有趣。

测序的基因组可以改善昆虫的分子生物学,生理学和神经生物学研究,也可以帮助开发未来的昆虫害虫管理新方法。烟草天蛾是一种很好的模型物种,因为它的体积很大 - 毛虫的长度可达4英寸,因此很容易收集组织样本。

几十年来,Kanost研究了烟草天蛾,他和Blissard决定在2009年启动烟草天蛾基因组测序的合作项目。合作研究小组对编码基因的DNA及不同昆虫的RNA进行了测序。发育阶段,以确定何时表达不同的基因以及在哪些组织和器官中。

Kanost和堪萨斯州立大学团队制备并纯化了烟草天蛾的DNA,并将样品送到休斯顿贝勒医学院人类基因组测序中心,进行基因组测序。博伊斯汤普森研究所的Blissard小组从昆虫的卵,幼虫,蛹和成虫阶段的广泛组织和特定发育阶段中分离出RNA。国际团队使用通用计算机系统,以便来自世界各地的研究人员可以根据他们的专业领域分析基因序列。

Blissard研究病毒与其昆虫宿主之间的相互作用。他和他的同事检查了液泡蛋白分选(VPS)基因。这些基因编码涉及在整个健康细胞中运输称为囊泡的小容器的蛋白质,但这些蛋白质经常被病毒劫持以使病毒通过细胞。

“这个项目的独特之处在于,许多不同的群体对如此众多的基因家族进行了深入研究,”Blissard说,“这是一个非常丰富的资源,不仅对研究昆虫的科学家有用,对研究其他科学家的科学家也有用。生物及其病原体和疾病。“

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