计算机学会发现致命的细菌

研究发现，机器学习可以预测可能导致食物中毒爆发的细菌菌株。这项针对大肠杆菌有害菌株的研究可以帮助公共卫生官员针对干预措施并降低人类健康风险。爱丁堡大学罗斯林研究所的研究人员使用的软件比较了从动物和人体中分离的细菌样本的遗传信息。

该软件学习与大肠杆菌样本相关的DNA特征，这些样本已经引起人们感染的爆发。然后它可以挑选出具有这些特征的动物菌株，因此可能对人类健康构成威胁。大多数大肠杆菌菌株生活在人和动物的肠道而不会引起疾病，但大肠杆菌O157与更严重的人类感染有关。

奶牛还携带大肠杆菌O157，并作为这些有毒细菌的主要储存库。动物排出粪便中的细菌，但不会生病。这使得很难发现哪些畜群和动物携带可能导致人类疾病的菌株。

DNA签名

该团队对来自牛群中分离的菌株和英国和美国人类感染的DNA序列进行了培训。

一旦经过训练，计算机就能够预测大肠杆菌菌株是否可能来自牛或人。

该团队使用这种方法预测，只有不到10%的大肠杆菌O157牛株可能会导致人类疾病。

研究小组表示，阻止这种疾病传播的干预措施 - 例如疫苗 - 可以针对这些菌株的牛群，以最大限度地降低人群爆发的风险。

“我们的研究结果表明，最危险的大肠杆菌O157菌株在牛群中可能非常罕见，这是令人放心的。该研究强调了机器学习方法在早期鉴定这些菌株和防止这种传染病暴发的可能性， “大卫加利教授说。

大肠杆菌0157

大肠杆菌O157引起感染者的胃痉挛，呕吐和严重腹泻。最近在苏格兰爆发的疾病导致了一名儿童死亡，另有19起严重食物中毒事件。据信感染源自未经巴氏杀菌的奶酪来源。

研究人员表示，他们的方法可以用于测试从动物身上分离出的其他类型细菌的样本 - 如沙门氏菌和弯曲杆菌 - 以鉴定可能导致人类疾病的菌株。

该研究由苏格兰食品标准局和食品标准局资助，发表在“ 美国国家科学院院刊”上。