新的MutChromSeq技术使有价值的基因更容易找到

鉴定可能有助于繁殖更好作物的有趣特性的基因并不总是那么容易 - 特别是如果你正在使用小麦或大麦。但诺里奇John Innes中心的科学家们已经在小麦和大麦基因组中应用了一种创新技术，这使得更容易确定可能用于作物改良计划的特定基因。

植物育种者的使命是开发新的和改良的作物品种，以更好地应对气候变化，新的病虫害的影响，并且可以产生更高的产量来养活不断增长的人口。要做到这一点，确切地知道在哪里找到负责有利性状的基因是有用的：例如，抗病基因，或帮助植物抵抗干旱的基因。

但是找到特定植物性状的基因可能就像试图在大海捞针中找到针一样 - 它是一个小的，特定的DNA序列，混杂在其他基因，调控序列和非编码DNA中。对于一些植物，如模式植物拟南芥，或水稻，基因组就像小'haybales'，所以基因'针'更容易找到 - 但对于小麦和大麦，全球两个最重要的谷类作物，基因组是如此之大，就像搜索一个满是干草堆的整个谷仓一样。

与瑞士和捷克共和国的同事合作，来自John Innes中心的Brande Wulff博士及其团队成功地将一种创新技术MutChromSeq应用于小麦和大麦基因组，从而降低了寻找基因的复杂性。它通过消除我们知道基因肯定不会被发现的部分基因组起作用。

那么MutChromSeq是如何工作的呢?

“它基于一种称为染色体流分选的已知技术，其中我们可以通过用荧光标记标记它们来将染色体彼此分开，”Wulff博士解释说。“以面包小麦基因组为例：这有21条染色体，因此通过流式分选，我们可以将染色体1与染色体2和染色体3分开，依此类推。如果我们知道某个特定的基因位于其上，比如说，染色体21，但我们不知道究竟在哪里，那么我们可以过滤掉染色体1-20以缩小搜索范围。只比一条染色体排序的序列要快得多，更容易，也更便宜!

在MutChromSeq中，染色体流分选与经典诱变相结合。来自具有有趣性状的植物的种子经受破坏其DNA的化学物质，并且通过筛选鉴定失去该性状的突变体。然后，通过对这些突变植物进行MutChromSeq分析，可以将突变染色体的序列与未突变染色体的序列进行比较。

Wulff博士说：“通过寻找突变和野生型染色体之间的序列差异，我们可以事先确定基因而不知道它们的结构。只要我们已经知道某个特定基因所在的染色体，这种技术就是这样可以更容易地克隆任何感兴趣的小麦或大麦基因，这对研究人员来说是个好消息!“