短RNA分子在单细胞中定位

Karolinska Institutet的研究人员测量了个体胚胎干细胞中短的非编码RNA序列的绝对数量。新方法可以提高对我们的基因如何被调节和不同细胞类型发展的理解。当我们使用基因中的信息时，例如构建蛋白质时，首先将其翻译成信使RNA，其作为蛋白质的蓝图。我们的细胞还含有非编码的短RNA序列，这些序列对蛋白质的形成没有贡献，其功能部分未知。其中最着名的是微RNA(miRNA)，它可以与信使RNA相互作用，从而调节基因和细胞功能。

卡罗林斯卡医学院的研究人员现在已经在单个细胞中绘制了短RNA序列的存在。以前对短RNA分子的研究是基于对许多细胞的同时分析，使得研究其准确的功能变得困难。“我们对短RNA分子功能的了解非常普遍。我们有一般机制的图片，但不清楚这些分子在不同类型的细胞或疾病中发挥的具体作用，”Rickard Sandberg教授说。细胞与分子生物学系，也隶属于斯德哥尔摩路德维希癌症研究中心。

使用单细胞转录组学进行分析，该技术使得可以测量细胞中短RNA分子的绝对数量。使用两种类型的胚胎干细胞，旨在模仿早期胚胎，在它附着于子宫内膜之前和之后。

研究人员可以检测到两种细胞状态下的大量小RNA，包括miRNA以及功能在很大程度上未知的较短RNA片段(tRNA和snoRNA)。研究人员还发现，大量的miRNA在两种细胞状态下表达不同。

“这是基础研究和示范，该方法有效，为进一步研究提供了建议。在细胞中绘制短RNA分子水平是确定这些分子特定功能的第一步，”Omid Faridani说。这项研究的主要作者。

从长远来看，Rickard Sandberg可以想象该方法的临床应用。

“例如，我们对短RNA分子在胚胎发育过程中的作用感兴趣。我们希望，通过更多的知识，这种方法可以用来确定哪些胚胎有最好的发育机会，然后用于改善目前的IVF治疗，“他说。