接近标记揭示了结构的关键组成部分 使细胞具有地方感

蛋白质复合物细胞用于附着到局部生物基质不仅仅是将细胞保持在原位，它们有助于细胞感知它们所处的组织以及它们应该是什么样的细胞类型。然而，这些“粘着斑”蛋白复合物的不稳定性使它们难以研究。A * STAR的研究人员通过使用分子标记技术精确识别所有相关蛋白1，建立了粘着斑的工作模型。

对于含有10-15,000个蛋白质的平均细胞，很难确定特定蛋白质如何聚集在一起以执行某些功能。Paxillin是一种众所周知的粘着斑蛋白，但其他蛋白质的“令人眼花缭乱的阵列”已经被提出来构成粘附复合物，负责这项工作的A * STAR分子和细胞生物学研究所的Ed Manser说。

“问题在于蛋白质组学方法主要是粉碎和抓取活动，”Manser解释道。“你可以'标记'一种蛋白质，如桩蛋白，并在细胞被破坏后抓住它，希望找到它的细胞伙伴。” 他的团队采取了更为谨慎的态度：“我们在打破细胞之前就标记了所有的蛋白质。”

Team2使用的'BioID'标记技术，也是在A * STAR开发的，涉及生产一种细胞系，其中桩蛋白与一种酶融合，该酶可以将生物素添加到约20纳米的蛋白质中：平均蛋白质约为5纳米宽。这些新生物素化的蛋白质很容易在破裂细胞内的细胞碎片中被识别出来。

研究人员将BioID与稳定同位素标记结合起来计算蛋白质相对于桩蛋白和kindlin-2的相对富集：他们用它来推断它们在粘着斑结构中的位置。

以前的研究已经提出数百种蛋白质构成粘着斑。IMCB团队确定了该过程中仅涉及的35种蛋白质，并提出了少于50种不同的粘着斑蛋白。“我们还证实，这些蛋白质中只有7种直接与桩蛋白结合，这是一个可靠的数字，”Manser说。

实验也出现了一些惊喜。Paxillin以前被认为是坐在细胞表面或“质膜”上 - 但缺乏标记的局部膜蛋白表明它位于一定距离之外。

“令人兴奋的是开发出一种蛋白质组学技术，它实际上可以提供比光学超分辨率方法更好的分辨率，”Manser说。其他蛋白质复合物的研究已在进行中。